基于生物大数据的植物xenomiR跨界调控方法研究

目录

声明

第1章 绪论

1.1 研究背景

1.2 国内外研究现状

1.3 研究内容及意义

1.4 论文结构安排

第2章 microRNA调控机制概述

2.1 miRNA分子概述

2.2 miRNA作用机制

2.3 miRNA的跨界调控机制

2.4 植物xenomiR进入人体机制研究

2.5 本章小结

第3章 植物xenomiR跨界调控模型构建

3.1 模型概述及技术路线

3.1.1 模型概述

3.1.2 技术路线

3.2 基于生物大数据与对比实验的假说验证

3.3 基于种子互补配对和机器学习算法的靶基因预测

3.4 基于LeaderRank算法的核心节点筛选

3.5 基于Multiple Dimensional Scaling算法的GO语义分析

3.6 本章小结

第4章 植物xenomiR跨界调控模型的数据获取及预处理

4.1 数据的获取

4.2 靶基因预测

4.3 核心节点筛选

4.4 本章小结

第5章 植物xenomiR跨界调控分析

5.1 植物-植物组功能富集分析

5.1.1 大豆-大豆

5.1.2 水稻-水稻

5.1.3 玉米-玉米

5.2 植物-人组功能富集分析

5.2.1 大豆-人

5.2.2 水稻-人

5.2.3 玉米-人

5.3 生物过程及GO语义分析

5.3.1 大豆

5.3.2 水稻

5.3.3 玉米

5.4 植物xenomiR对人的跨界调控作用

第6章 总结与展望

6.1 总结

6.2 展望

参考文献

作者简介及在学期间所取得的科研成果

致谢