芝麻棒孢叶斑病抗性鉴定及基因定位

目录

声明

摘要

1 文献综述

1．1芝麻棒孢叶斑病的发生与危害

1．2芝麻棒孢叶斑病的防治进展

1．3芝麻抗病基因定位研究进展

1．4 BSA-seq技术及其应用进展

1．5 RNA-Seq技术及其应用进展

1．6研究目的及意义

2芝麻棒孢叶斑病抗性鉴定方法建立

2．1材料与方法

2．1．1病原菌的分离与鉴定

2．1．2菌饼接种法

2．1．3孢子悬浮液接种法

2．2结果与分析

2．2．1 山扁豆生棒孢形态学鉴定

2．2．2山扁豆生棒孢的分子鉴定

2．2．3不同菌株的致病力测定

2．2．4孢子悬浮液的最佳接种浓度测定

2．3讨论

3 芝麻品种棒孢叶斑病抗性鉴定

3．1材料与方法

3．1．1田间抗性鉴定

3．1．2室内抗性鉴定

3．1．3 F2代分离群体抗性鉴定

3．2结果与分析

3．2．1田间抗性评价

3．2．2室内抗性评价

3．2．3 芝麻棒孢叶斑病抗性遗传分析

3．3 讨论

4芝麻棒孢叶斑病抗病基因定位

4．1材料与方法

4．1．1抗感池构建

4．1．2 BSA测序

4．1．3抗病基因遗传连锁分析

4．2结果与分析

4．2．1 抗感池DNA质量检测

4．2．2 BSA-seq数据分析

4．2．3 Reads与参考基因组比对

4．2．4确定抗病基因候选区间

4．2．5抗病基因定位

4．3 讨论

5芝麻棒孢叶斑病抗病基因筛选

5．1材料与方法

5．1．1供试材料与实验仪器

5．1．2山扁豆生棒孢接种

5．1．3显微观察与取样

5．1．4生物信息学分析流程

5．1．5候选基因的qRT-PCR验证

5．2结果与分析

5．2．1台盼蓝染色观察

5．2．2转录组测序RNA样品检测

5．2．3转录组测序数据基因组比对

5．2．4实时荧光定量PCR验证

5．2．5抗感品种差异基因表达分析

5．2．6差异基因KEGG pathway分析

5．2．7 RNA-seq结合BSA-seq筛选棒孢叶斑病抗病基因

5．3 讨论

6结论与展望

6．1 结论

6．2 展望

参考文献

附录

个人简历及在学期间发表的学术论文与研究成果

致谢