原发性骨质疏松症患者肠道菌群失调与功能预测的研究

目录

声明

中英文缩略词表

前言

1 资料与方法

1.1 一般资料

1.2 纳入与排除标准

1.3 临床资料

1.4 相关材料

1.4.1 主要仪器与设备

1.4.2 主要试剂CTAB提取缓冲液

1.5 粪便样本收集

1.6 测序实验上机流程

1.6.1 DNA提取

1.6.2 PCR扩增

1.7 测序数据分析流程

1.7.1 测序数据的处理

1.7.2 OTU聚类和物种注释

1.7.3 样本复杂度分析

1.7.4 多样本比较分析

1.7.5 环境因子关联分析

1.7.6 元基因组功能预测

1.8 统计学方法

2 结 果

2.1 一般资料

2.2 物种注释结果

2.2.1 OTU分析

2.2.2 物种相对丰度展示

2.3 Alpha多样性分析

2.3.1 物种多样性曲线

2.3.2 物种累积箱形图

2.3.3 Alpha多样性指数组间差异分析

2.4 多样本比较分析

2.4.1 主坐标分析

2.4.2 主成分分析

2.4.3 Beta多样性指数组间差异分析

2.4.4 组间群落结构差异显著性检验

2.5 组间差异物种分析

2.6 LEfSe分析

2.7 关联分析与模型预测

2.7.1 Spearman 相关性分析

2.7.2 两组间差异物种的预测性能

2.8 元基因组功能预测

3 讨论

4 结论

参考文献

附表

综述:肠道微生物对骨质疏松症影响的研究进展

1 肠道菌群研究概况

2 肠道菌群失调与骨质疏松症

3 肠道菌群、免疫调节与骨代谢

4 肠道菌群改变，内分泌系统和骨量减少

5 肠道菌群、营养代谢与骨代谢

6 肠道微生物治疗骨质疏松症

7 总结与展望

参考文献

个人简历及在校期间发表的学术论文

致谢