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【6h】

太行菊对干旱胁迫的响应——生理、转录组及miRNA研究

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目录

声明

1 前言

1.1 太行菊研究综述

1.1.1 太行菊生长环境和生物学特征

1.1.2 太行菊的生殖生物学研究

1.1.3 太行菊遗传多样性研究

1.1.4 太行菊活性成分研究

1.2 植物抗旱基因工程研究综述

1.2.1 转录因子

1.2.2 信号分子

1.2.3 渗透调节基因

1.2.4 抗氧化代谢基因

1.2.5 逆境诱导蛋白基因

1.2.6 光合效率和色素代谢相关基因

1.2.7 microRNA与干旱胁迫调控

1.3 研究目的、意义和内容

2 太行菊响应干旱胁迫的形态特征和生理生化研究

2.1 引言

2.2 材料与方法

2.2.1 实验材料种植与干旱处理

2.2.2 太行菊干旱处理的表型观察

2.2.3 叶片相对含水量的测定

2.2.4 干旱胁迫下光合速率(A)、气孔导度(Gs)、蒸腾速率(E)、胞间CO2浓度(Ci)的测定

2.2.5 叶绿素(Chl)含量的测定

2.2.6 脯氨酸(Proline)含量的测定

2.2.7 过氧化物酶(POD)活性的测定

2.2.8 丙二醛含量(MDA)的测定

2.2. 9 可溶性糖含量的测定

2.3结果与分析

2.3.1 干旱胁迫对太行菊生长的影响

2.3.2 干旱胁迫对太行菊叶片相对含水量的影响

2.3.3 干旱胁迫对光合速率(A)、气孔导度(Gs)、蒸腾速率(E)、胞间CO2浓度(Ci)的影响

2.3.4 干旱胁迫对太行菊叶绿素含量的影响

2.3.5 干旱处理对太行菊脯氨酸含量的影响

2.3.6 干旱胁迫对太行菊叶片过氧化物酶(POD)活性的影响

2.3.7 干旱胁迫对太行菊叶片丙二醛含量的影响

2.3.8 干旱胁迫对太行菊叶片可溶性糖含量的影响

2.4 讨论

2.4.1 太行菊通过控制营养生长适应干旱胁迫

2.4.2 干旱胁迫对太行菊光合响应的影响是多方面的

2.4.3 太行菊响应干旱胁迫的生理学复杂性

3 太行菊响应干旱胁迫的转录组分析

3.1 引言

3.2 材料与方法

3.2.1 实验材料种植与处理

3.2.2 RNA提取、质量检测及浓度确定

3.2.3 cDNA文库构建和测序

3.2.4 测序数据的处理与筛选

3.2.5 qRT-PCR验证RNA-seq结果

3.2.6 差异表达基因功能分析

3.3 结果与分析

3.3.1 RNA-Seq和de novo转录组的装配

3.3.2 太行菊响应干旱胁迫差异表达基因的筛选

3.3.3 太行菊响应干旱胁迫差异表达基因的功能分析

3.3.4 差异表达基因的KEGG代谢通路分析

3.3.5 转录因子变化分析

3.3.6 DEGs和TFs的qRT-PCR验证

3.4 讨论

3.4.1 太行菊响应干旱胁迫差异表达基因分析

3.4.2 太行菊响应干旱胁迫的转录因子调控分析

4 miRNA介导的太行菊干旱胁迫响应

4.1 引言

4.2 材料与方法

4.2.1 实验材料种植与处理

4.2.2 RNA提取与质量检测

4.2.3 Small RNA文库构建和高通量测序

4.2.4 测序数据分析处理

4.2.5 miRNA鉴定

4.2.6 miRNA差异表达分析

4.2.7 miRNA 靶基因预测

4.2.8 候选靶基因功能注释分析

4.3 结果与分析

4.3.1 干旱胁迫下太行菊叶片Small RNA 高通量测序结果与分析

4.3.2 干旱胁迫下太行菊叶片miRNA的鉴定与分析

4.3.3 干旱胁迫下太行菊叶片miRNA的差异表达分析

4.3.4 miRNA 靶基因预测

4.3.5 候选靶基因GO功能注释与KEGG富集分析

4.3.6 已知miRNA与转录组数据的关联分析

4.4 讨论

5 结论与展望

5.1 结论

5.2 创新点

5.3 研究展望

参考文献

附录

个人简介

致谢

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著录项

  • 作者

    谷辉辉;

  • 作者单位

    郑州大学;

  • 授予单位 郑州大学;
  • 学科 生物化工
  • 授予学位 博士
  • 导师姓名 赵文恩;
  • 年度 2019
  • 页码
  • 总页数
  • 原文格式 PDF
  • 正文语种 chi
  • 中图分类 S51S33;
  • 关键词

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