长角血蜱两性生殖和孤雌生殖种群线粒体基因组及卵巢发育相关基因的比较研究

目录

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第一章 综 述

1.1 蜱类

1.2 长角血蜱

1.3 孤雌生殖

1.4 蜱类线粒体基因组的研究进展

1.4.1 线粒体基因组数据挖掘

1.4.2 线粒体基因组碱基特征

1.4.3 线粒体基因组重排模式

1.4.4 线粒体基因组非编码区

1.4.5 线粒体基因组系统发育分析

1.4.6 线粒体基因组研究方向

1.5 卵巢发育基因的研究进展

1.5.1 营养消化和运输

1.5.2 细胞信号和激素

1.5.3 细胞增殖和胚胎发育

1.6 研究目的及意义

第二章 长角血蜱两性生殖和孤雌生殖种群的线粒体基因组分析

2.1 材料与方法

2.1.1 长角血蜱采集和饲养

2.1.2 线粒体基因组样品制备

2.1.3 高通量建库与测序

2.1.4 线粒体基因组组装及注释

2.1.5 线粒体基因组特征分析

2.1.6 线粒体蛋白编码基因差异表达分析

2.2 结果

2.2.1 测序数据质控

2.2.2 原始数据组装

2.2.3 线粒体基因组基本特征分析

2.2.4 线粒体基因组圈图比较和多态性分析

2.2.5 线粒体基因特征分析

2.2.6 tRNA和rRNA 基因特征分析

2.2.7 线粒体基因组重排分析

2.2.8 线粒体基因组系统发育分析

2.2.9 蛋白编码基因差异表达分析

2.3 讨论

2.4 小结

第三章 长角血蜱两性生殖和孤雌生殖种群不同吸血时期卵巢转录组分析

3.1 材料与方法

3.1.1 长角血蜱采集和饲养

3.1.2 卵巢RNA 提取和定量

3.1.3 转录组文库构建与测序

3.1.4 原始数据质控和组装

3.1.5 基因功能注释

3.1.6 差异表达基因分析

3.2 结果

3.2.1 测序数据质控

3.2.2 原始数据组装

3.2.3 基因功能注释

3.2.4 差异表达基因筛选

3.2.5 差异表达基因GO 富集分析

3.2.6 差异表达基因KEGG富集分析

3.3 讨论

3.4 小结

第四章 长角血蜱两性生殖和孤雌生殖种群不同吸血时期卵巢蛋白质组分析

4.1 材料与方法

4.1.1 长角血蜱采集和饲养

4.1.2 卵巢蛋白提取

4.1.3 蛋白酶解和脱盐

4.1.4 样品分离和建库

4.1.5 质谱定量数据分析

4.1.6 蛋白质鉴定和统计

4.1.7 蛋白功能注释

4.1.8 共有差异蛋白验证

4.2 结果

4.2.1 蛋白鉴定结果

4.2.2 蛋白功能注释

4.2.3 差异表达蛋白筛选

4.2.4 差异表达蛋白GO 富集分析

4.2.5 共有差异表达蛋白验证

4.3 讨论

4.4 小结

第五章 总结与展望

5.1 总结

5.2 展望

参考文献

致 谢

个人简历