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河流抗性基因传播与菌群特征时空演进规律分析

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第1章 绪 论

1.1 抗生素抗性基因的研究现状

1.1.1 抗生素抗性基因的污染来源和趋势

1.1.2 抗生素抗性基因的国内研究现状

1.1.3 抗生素抗性基因的国外研究现状

1.2 用qPCR方法研究抗生素抗性基因

1.3 Miseq测序技术在微生物生态学中的应用

1.4.1 研究目的

1.4.2 研究内容

1.4.3 技术路线

1.5 研究创新点与意义

第2章 试验材料与方法

2.1 河流与污水处理厂简介

2.2 实验材料

2.3.1 常规污水水质监测方法

2.3.2 抗性基因的定性检测

2.3.3 抗性基因的定量检测

2.3.4 Miseq测序数据分析方法

2.4 统计分析

第3章 春季河流中抗性基因与微生物群落的分布特征与相关性

3.1 样品的采集和预处理

3.2 抗生素抗性基因分析

3.3 微生物群落多样性分析

3.4.1 在门分类水平上分析

3.4.2 在属分类水平上分析

3.5 抗性基因和微生物群落相关性

3.6 本章小结

第4章 夏季河流中抗性基因和微生物群落相关性

4.1 样品采集

4.2 微生物群落多样性分析

4.3 抗性基因和微生物群落相关性分析

4.4 本章小结

第5章 秋季河流与污水处理厂中抗性基因与微生物群落相关性

5.1 样品采集

5.2 抗生素抗性基因分析

5.3 微生物多样性分析

5.4 微生物菌群结构分析

5.5 抗性基因和微生物群落相关性分析

5.6 本章小结

第6章 冬季河流中抗性基因和微生物群落相关性

6.1 抗生素抗性基因的分布

6.2 微生物菌群结构分析

6.3 抗性基因和微生物群落相关性分析

6.4 本章小结

第7章 季节变化对河流中抗性基因和微生物群落分布的影响

7.1 抗生素抗性基因的分布

7.2 微生物菌群结构分析

7.3 本章小结

结论

参考文献

攻读硕士学位期间所发表的论文

致谢

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