金荞麦根茎药用品质及其遗传研究

目录

1、文献综述

1.1金荞麦简介

1.2金荞麦药理作用的研究进展

1.2.1清除自由基、抗氧化作用

1.2.2抗炎止痛作用

1.2.3抗肿瘤、抗癌作用

1.2.4调节心、脑血管系统的作用

1.3金荞麦的开发利用研究进展

1.3.1金荞麦籽粒的开发利用

1.3.2金荞麦块根的开发利用

1.3.3金荞麦茎叶的开发利用

1.4类黄酮化合物生物合成途径研究进展

1.5测序技术的应用

1.6本研究的目的及意义

2、材料与方法

2.1实验材料

2.2 研究方法

2.2.1金荞麦的种植和取样

2.2.2金荞麦根茎的农艺性状的测定

2.2.3金荞麦根茎的药用品质的测定

2.2.4药用品质与农艺性状的数据分析

2.2.5转录组测序及生物信息学分析

2.2.6金荞麦根茎广泛靶向代谢组分析

2.2.7转录组代谢组学联合分析

3、结果与分析

3.1金荞麦根茎的药用品质含量和农艺性状分析

3.1.1金荞麦的药用品质分析

3.1.2金荞麦的农艺性状分析

3.1.3金荞麦药用品质和农艺性状间相关性和聚类分析

3.2金荞麦根茎转录组测序及生物信息学分析

3.2.1 金荞麦根茎RNA的质量评估

3.2.2金荞麦根茎测序数据过滤统计分析

3.2.3金荞麦根茎cDNA文库与参考基因组比对分析

3.2.4金荞麦根茎表达量估计

3.2.5金荞麦根茎差异基因鉴定

3.2.6金荞麦根茎差异表达基因功能注释

3.2.7金荞麦根茎差异表达基因GO富集分析

3.2.8金荞麦根茎差异表达基因COG富集分析

3.2.9金荞麦根茎差异表达基因KEGG代谢途径富集分析

3.2.10金荞麦根茎中黄酮类化合物合成关键调控途径

3.2.11利用qRT-PCR验证转录组数据

3.3金荞麦根茎广泛靶向代谢组分析

3.3.1金荞麦根茎代谢物定性定量分析

3.3.2金荞麦根茎样本质谱分析

3.3.3金荞麦根茎主成分分析

3.3.4金荞麦根茎聚类分析

3.3.5金荞麦根茎重复相关性评估

3.3.6正交偏最小二乘法判别分析（OPLS-DA）

3.3.7金荞麦根茎差异代谢物筛选

3.3.8金荞麦根茎差异代谢物KEGG功能注释及富集分析

3.3.9金荞麦根茎黄酮类化合物的分析

3.4金荞麦根茎黄酮类化合物调控的转录、代谢联合分析

3.4.1 KEGG联合分析

3.4.2差异基因和代谢物相关性

3.4.3金荞麦根茎黄酮类化合物合成关键调控途径

4.结论与讨论

4.1主要结论

4.1.1金荞麦根茎药用品质含量与农艺性状的变化分析

4.1.2基于转录组对金荞麦根茎黄酮类化合物差异分析

4.1.3基于代谢组对金荞麦根茎黄酮类化合物差异分析

4.1.4金荞麦根茎黄酮类化合物合成的转录、代谢调控

4.2讨论

4.2.1. 金荞麦药用品质及其与农艺性状的关系

4.2.2.金荞麦根茎黄酮类化合物的成分

4.2.3.金荞麦黄酮类化合物合成代谢途径

参考文献

致谢

攻读硕士学位期间主要研究成果

学习期间参与的研究项目

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