基于数据处理的丹参酮类似物抗前列腺癌活性分子机制研究

目录

中英文缩略词表

第一章 前言

1.1 R语言概述

1.1.1 R语言的起源和发展

1.1.2 R语言的特点

1.1.3 Bioconductor

1.2 前列腺癌相关知识

1.2.1 前列腺癌概述

1.2.2 前列腺癌的发病因素

1.2.3 前列腺癌诊断及肿瘤标志物

1.2.4 前列腺癌治疗

1.3 丹参酮的抗肿瘤研究

第二章 前列腺癌样本关键基因数据挖掘

2.1 R语言及其相关程序包下载

2.2 数据集下载

2.3 芯片数据预处理

2.4 数据清洗

2.5 聚类分析和PCA分析

2.6 获取显著差异表达基因

第三章 细胞生物学和分子生物学相关实验

3.1 材料

3.1.1 类似物样品

3.1.2 细胞株

3.1.3 实验试剂

3.1.4 实验仪器

3.2 方法

3.2.2 细胞培养

3.2.3 细胞冻存

3.2.4 分子对接实验

3.2.5 克隆形成实验

3.2.6 MTT法检测细胞的体外增殖抑制实验

3.2.7 Hoechst 33258染色法检测细胞凋亡

3.2.8 流式细胞术检测化合物对细胞凋亡的影响

3.2.9 流式细胞术检测化合物对细胞周期的影响

3.2.10 划痕实验

3.2.11 普通PCR和RNA-seq

3.2.12 细胞热迁移实验

3.2.13 线粒体膜电位检测

3.2.14 蛋白质印迹法（Western Blot）

3.2.15 统计学处理

第四章 细胞生物学和分子生物学实验结果

4.1 丹参酮类似物TB1直接结合靶点探究

4.2 丹参酮类似物TB1对前列腺癌细胞的增殖抑制作用

4.3 丹参酮类似物TB1对前列腺癌细胞细胞活力的影响

4.4 丹参酮类似物TB1对前列腺癌细胞凋亡的影响

4.5 丹参酮类似物TB1对前列腺癌细胞周期的影响

4.6 丹参酮类似物TB1对前列腺癌细胞迁移的影响

4.7 丹参酮类似物TB1对前列腺癌细胞凋亡、周期相关基因调控情况

4.8 丹参酮类似物TB1作用前列腺癌PC-3M-2B4细胞的转录组测序

4.9 丹参酮类似物TB1处理后的前列腺癌细胞蛋白表达情况

第五章 结论和讨论

本次研究的创新点

本次研究的不足之处

参考文献

致谢

附录

图版

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