马尾松产脂性状EST-SSR引物开发及关联分析

目录

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第1 章 绪论

1.1 研究背景

1.1.1 马尾松简介

1.1.2 松脂及针叶树种的产脂机理研究

1.1.3 马尾松高产脂遗传改良进展

1.2 分子标记在林木研究中的应用进展

1.2.1 林木分子标记研究进展

1.2.2 SSR标记研究进展

1.2.3 SSR标记在松树研究进展

1.3 基因组关联分析研究进展

1.3.1 基因组关联分析的概念、优点及影响因素

1.3.2候选基因关联分析

1.3.3 关联分析在农作物的研究

1.3.4 关联分析在林木上的应用

1.4研究内容及技术路线

1.4.1研究内容

1.4.2研究技术路线

1.5研究目的及意义

1.6项目来源与经费支持

第2 章 材料与方法

2.1 实验材料

2.1.1 采集地概况及马尾松转录组测序的材料

2.1.2 马尾松引物验证及关联群体的材料

2.2 主要仪器、试剂及配制方法

2.2.1 实验主要仪器

2.2.2 实验试剂及配制方法

2.3 实验方法

2.3.1 提取DNA的方法

2.3.2 马尾松SSR引物设计

2.3.3 PCR扩增及检测

2.3.4 聚丙烯酰胺凝胶电泳的方法

2.3.5 马尾松产脂性状调查

2.4 数据处理

2.4.1 SSR标记的设计及开发

2.4.2 关联分析的数据分析

2.4.3关联位点的表型效应计算

第3 章 结果与讨论

3.1 马尾松候选基因挖掘及SSR引物设计

3.1.1 马尾松转录组中SSR重复单元类型、频率及分布特点

3.1.2 马尾松转录组表达序列测序含SSR差异序列分析

3.1.3 SSR引物有效性分析及多态性检测

3.2马尾松产脂性状关联分析

3.2.1 群体结构分析

3.2.2马尾松产脂性状的测定

3.2.3关联分析

3.2.4关联位点的表型效应计算

3.3讨论

3.3.1基于候选基因策略的马尾松SSR标记开发

3.3.2基因关联分析

第4 章 结论与展望

4.1结论

4.2展望

参考文献

攻读硕士学位期间发表论文情况

致谢

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