苦瓜InDel遗传图谱的构建及雄花节位和数量的QTL分析

摘要

苦瓜是一种药食兼用的重要蔬菜作物，主要在亚洲、非洲和南美洲等地区种植；与葫芦科的其他作物相比，苦瓜的遗传育种及分子生物学研究还相对较少。InDel标记是基于基因组序列开发的一种新型分子标记，在基因组中大量分布，是构建遗传分子图谱的最佳选择。本研究使用来自斯里兰卡的苦瓜自交系‘04-17’和来自中国的苦瓜自交系‘47-2-1-1-3’进行杂交及严格自交授粉得到的 F2代 113个单株为材料，构建了第一张含有164个InDel标记的苦瓜分子遗传图谱。结合田间苦瓜性状调查结果，对第一分枝节位、第一雄花节位、十节雄花数、果柄长、果肩宽、果长、果径、单果重、果面棱宽、果肉厚、种子长、种子宽和种子数进行了QTL定位，结果如下：　　1.以苦瓜亲本‘04-17’和‘47-2-1-1-3’的基因组DNA为模板，对2,502对InDel引物进行PCR扩增中，结果有2,466对引物能扩增获得清晰条带，有效扩增率为98.56%，其中有2,230对引物（占89.13%）获得单一扩增条带；212对引物（占8.47%）在两亲本间表现出多态性，并用于F2代基因分型分析。通过软件joinmap 4.0分析得到第一张含有164个InDel标记的苦瓜分子遗传图谱，该图谱包括15个连锁群，总长1,279.59 cM，标记间的平均距离为7.80 cM。　　2.结合田间调查数据，以 MapQTL 6软件对第一分枝节位、第一雄花节位、十节雄花数、果柄长、果肩宽、果长、果径、单果重、棱宽、果肉厚、种子长、种子宽和种子数进行QTL分析，将第一雄花节位调控位点定位在连锁群LG8上的111.94~119.87 cM遗传区间，其LOD值为10.04，对表型的贡献率为34.80%，加性效应为 2.52，显性效应为-1.32；将十节雄花数调控位点定位在连锁群 LG8上的107.43~111.94 cM遗传区间，其LOD值为9.23，对表型的贡献率为33.60%，加性效应为-1.62，显性效应为0.83。

目录

第一个书签之前