声明
前言
1.1 甘蔗白条病的概述
1.1.1 甘蔗白条病的发生与危害
1.1.2 甘蔗白条病的致病机理
1.1.3 甘蔗白条病的防控技术
1.2 植物nsLTP基因家族研究进展
1.2.1 nsLTP基因家族的系统分类
1.2.2 nsLTP基因的基本特征
1.2.3 nsLTP基因的克隆与鉴定
1.2.4 nsLTP基因与植物抗逆性
1.2.5 nsLTP基因与信号转导
1.2.6 nsLTP基因与细胞生长
1.3 研究目的与技术路线
1.3.1 研究目的与意义
1.3.2 本研究的技术路线
2 材料与方法
2.1 实验材料
2.2 白条病菌接种与叶片取样
2.3 iTRAQ 标记及液相色谱质谱分析
2.3.1总蛋白提取和多肽制备
2.3.2 iTRAQ 标记
2.3.3 高效液相色谱法(HPLC)分馏
2.3.4 液相色谱质谱（LC-MS/MS）分析
2.3.5 蛋白鉴定与质量控制
2.3.6 蛋白组学生物信息学分析
2.4割手密nsLTP家族基因的鉴定及序列分析
2.4.1 nsLTP家族基因成员的鉴定
2.4.2 nsLTP序列分析与进化树重构
2.4.3 nsLTP重复基因分析
2.4.4 nsLTP基因GO富集分析
2.4.5 nsLTP启动子分析
2.5 甘蔗nsLTP家族基因时空表达分析
2.5.1 实验材料处理与RNA提取
2.5.2 引物设计与合成
2.5.3 qRT-PCR检测
2.6数据处理与统计分析
3 结果与分析
3.1 两个甘蔗品种白条病抗病性表型鉴定
3.2 两个甘蔗品种响应白条病菌侵染的差异表达蛋白分析
3.2.1 差异表达蛋白数目统计
3.2.2 差异表达蛋白GO功能注释
3.2.3 差异表达蛋白KEGG富集分析
3.2.4 差异表达蛋白互作分析
3.2.5 与抗性相关的差异表达蛋白筛选与分析
3.2.6 与抗性相关的差异表达蛋白基因转录水平验证
3.3割手密nsLTP基因家族的鉴定与序列分析
3.3.1割手密nsLTP基因家族成员的鉴定及分类统计
3.3.2 割手密nsLTP基因分类EMC结构特征分析
3.3.3 割手密nsLTP家族基因遗传进化分析
3.3.4 割手密nsLTP家族基因染色体定位和共线性分析
3.3.5 割手密nsLTP家族基因进化时间分析
3.3.6 割手密nsLTP家族基因GO富集分析
3.3.7 割手密nsLTP家族基因顺式调控元件分析
3.4 割手密nsLTP家族表达特征分析
3.4.1割手密nsLTP家族基因组织特异性表达分析
3.4.2割手密nsLTP家族基因响应白条病菌胁迫的表达分析
3.5 甘蔗栽培种nsLTP家族基因应答白条病菌侵染的表达特征分析
3.5.1 基于转录组数据分析甘蔗nsLTP家族基因表达模式
3.5.2基于qRT-PCR验证甘蔗nsLTP基因表达特性
3.5.3基于蛋白质组数据分析甘蔗nsLTP基因表达特性
4 讨论
4.1甘蔗通过多种代谢和信号通路响应白条病菌侵染
4.1.1光合作用和糖酵解途径参与甘蔗抗白条病菌侵染
4.1.2植物泛素化免疫系统参与甘蔗应答白条病菌侵染
4.1.3 UDP-糖基转移酶在甘蔗抗病品种中上调表达
4.1.4 植物细胞色素P450受白条病菌侵染诱导上调表达
4.2 甘蔗nsLTP基因家族的系统分类与进化
4.3 甘蔗nsLTP基因组织特异性表达模式
4.4 甘蔗nsLTP基因家族在白条病菌胁迫下的表达模式
5 结论
6 展望
参考文献
附录A
附录B
攻读学位期间的学术论文与研究成果
致谢
福建农林大学;
