基于miRNA微阵列数据的归一化方法比较与加权共表达网络分析研究

目录

声明

第一章 绪论

§1.2 胃癌的研究现状

§1.2.1 胃癌的概述

§1.2.2 胃癌发生的原因

§1.2.3 胃癌的治疗

§1.2.4 胃癌与miRNA关系

§1.3 理论基础知识

§1.3.2 生物信息学

§1.3.3 R语言软件

§1.3.4 微阵列数据的归一化

§1.3.5 加权基因共表达网络分析

§1.4 本文主要工作

第二章 多种归一化方法对miRNA微阵列数据的作用分析及比较

§2.2 材料与方法

§2.2.2 归一化方法的概述

§2.2.3 MA图与箱线图对数据分布的呈现

§2.3 结果

§2.3.1 MA图与箱线图分别对归一化前后数据分布的呈现及对比

§2.3.2 K-S检验和均方误差对归一化方法的衡量

§2.4 讨论

第三章 基于WGCNA方法对胃癌中miRNA功能模块的鉴定

§3.1 前言

§3.2 材料与方法

§3.2.2 加权基因共表达网络分析

§3.2.3 差异表达miRNA的筛选

§3.3.2 识别共表达模块及生物信息学分析

§3.3.3 差异表达miRNA的筛选及生物信息学分析

§3.4 讨论

第四章 总结和展望

参考文献

攻读硕士学位期间的研究成果

致谢