鸽毛滴虫抗性基因筛选及虫源外泌体蛋白质谱分析

目录

声明

主要符号对照表

第一章 绪论

1.1 问题的提出

1.2 选题的背景和意义

1.3 文献综述

1.3.1 鸽毛滴虫病的研究进展

1.3.2 寄生虫病的抗病育种

1.3.3 RNA-seq技术在家禽疾病中的应用

1.3.4 寄生虫与外泌体

1.3.5 寄生虫与细胞因子

1.3.6 寄生虫与细胞凋亡

1.4 论文结构安排

第二章 鸽毛滴虫提取和培养

2.1 前言

2.2 材料和方法

2.2.1 感染率调查

2.2.2 原代培养及纯化

2.2.3 显微镜观察形态

2.2.4 DNA提取与测序

2.3 结果与分析

2.3.1 感染率调查

2.3.2 鸽毛滴虫的形态观察鉴定及标志基因鉴定

2.4 讨论

2.5 小结

第三章 鸽毛滴虫感染的病理变化

3.1 前言

3.2 材料与方法

3.2.1 攻毒试验

3.2.2 口腔鸽毛滴虫计数

3.2.3 血液生化指标测定

3.2.4 HE染色

3.2.5 细胞凋亡的测定

3.2.6 免疫相关因子及凋亡相关因子检测

3.2.7 数据分析

3.3 结果与分析

3.3.1 鸽毛滴虫数量

3.3.2 死亡率和体重的变化

3.3.3 血液生化指标

3.3.4 病理损伤情况

3.3.5 细胞凋亡

3.3.6 免疫相关因子和凋亡相关因子的测定

3.4 讨论

3.4.1 鸽毛滴虫感染导致乳鸽体重减轻下降及死亡率增加

3.4.2 血液生化指标变化

3.4.3 组织病变

3.4.4 细胞凋亡

3.4.5 免疫相关因子和凋亡相关因子的表达

3.5 小结

第四章 鸽毛滴虫抗性基因筛选

4.1 前言

4.2 材料与方法

4.2.1 样品采集

4.2.2 口腔黏膜样本的HE观察

4.2.3 总RNA提取

4.2.4 lncRNA测序的文库制备

4.2.5 聚类和排序

4.2.6 数据分析

4.2.7 测序结果的验证

4.3 结果与分析

4.3.1 病理损伤情况

4.3.2 RNA质量检测

4.3.3 测序原始数据质量

4.3.4 基因组比对

4.3.5 样品间相关性分析

4.3.6 lncRNA的鉴定

4.3.7 lncRNA基因组特征

4.3.8 差异表达的mRNA和lncRNA数量统计

4.3.9 差异表达mRNA和lncRNA功能分析

4.3.10 lncRNA-mRNA互作分析

4.3.11 测序结果的验证

4.4 讨论

4.4.1 lncRNA的特征

4.4.2 鸽毛滴虫抗性相关基因及信号通路

4.4.3 其他重要基因及信号通路

4.5 小结

第五章 鸽毛滴虫外泌体提取与质谱分析

5.1 前言

5.2 材料与方法

5.2.1 外泌体提取

5.2.2 外泌体鉴定

5.2.3 外泌体蛋白质谱分析

5.2.4 鸽嗉囊细胞的原代培养

5.2.5 外泌体摄取试验

5.3 结果与分析

5.3.1 外泌体的鉴定

5.3.2 外泌体蛋白质谱分析

5.3.3 嗉囊细胞原代培养

5.3.4 外泌体的摄取

5.4 讨论

5.5 小结

第六章 结论

6.1 全文主要结论

6.2 需要进一步解决的问题

参考文献

致 谢

作者简历