奶牛瘤胃中活性尿素分解菌群多样性分析

目录

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主要符号对照表

第一章 绪论

1.1瘤胃中的尿素氮循环

1.2瘤胃尿素分解菌及其脲酶多样性

1.2.1 体外培养的方法分离培养尿素分解菌

1.2.2未培养尿素分解菌的研究

1.3宏基因组学和宏转录组学在微生物研究中的应用

1.3.1宏基因组学在微生物研究中的应用

1.3.2宏基因组学在微生物研究中的局限性

1.3.3宏转录组学对活性瘤胃微生物的研究

1.4研究切入点

1.5研究目的和意义

1.6研究内容与技术路线

1.6.1研究内容

1.6.2技术路线

第二章 瘤胃微生物RNA提取中样品前处理方法的优化

2.1材料与方法

2.1.1瘤胃液采集与前处理

2.1.2总RNA提取与质量评定

2.1.3数据统计分析

2.2试验结果

2.2.1总RNA浓度

2.2.2总RNA完整度

2.3讨论

2.4本章结论

第三章 瘤胃活性尿素分解菌群落多样性分析

3.1材料与方法

3.1.1奶牛瘤胃液的采集

3.1.2总DNA、RNA提取和cDNA合成

3.1.3脲酶基因(ureC) PCR扩增及Illumina测序

3.1.4测序数据处理和序列分析

3.2试验结果

3.2.1 RNA质检、纯化、反转录

3.2.2 UreC基因α多样性

3.2.3 UreC基因β多样性

3.2.4 尿素分解菌组成

3.2.5 UreC基因OTUs的丰富度和变化

3.3讨论

3.4本章结论

第四章 全文结论

参考文献

附录A

致 谢

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