声明
缩 略 词 表
第一章 病毒与宿主miRNA相互作用的研究进展
1 miRNA的研究进展
1.1 miRNA的发现
1.2 miRNA产生的基因结构
1.3 miRNA产生的经典途径
1.4 miRNA产生的非经典途径
1.5 miRNA 产生的分子机制
1.6 isomiRNAs 产生机制
2 病毒与宿主miRNA的相互作用
2.1 宿主miRNA与病毒相互作用的影响因素
2.2 宿主miRNA与病毒基因组的相互作用
2.3 病毒感染对宿主miRNA表达水平的调节
3 黄病毒与miRNA的相互作用
3.1 黄病毒简介
3.2 miRNA介导的黄病毒基因组的稳定转录
3.3 黄病毒感染对宿主miRNA表达水平的调节
第二章 JEV编码的解旋酶降解宿主miRNA的机制研究
1 引言
2 材料
2.1实验动物、细胞及病毒
2.2 试剂耗材
2.3 实验仪器
3 主要试验方法
3.1 JEV滴度测定
3.2 JEV感染细胞
3.3 细胞RNA的提取
3.4 细胞RNA的反转录和实时定量PCR
3.5 免疫印迹
3.6 miRNA模拟物或抑制剂转染细胞
3.7 RNA免疫共沉淀
3.8 液相色谱、质谱串联系统分析方法
3.9 miRNA测序数据分析
3.10 miRNA测序reads分析
3.11 miRNA实时定量PCR
4 结果
4.1 JEV介导小鼠神经细胞miRNA表达分析
4.2 JEV NS3介导神经元细胞中miRNA的降解
4.3 JEV感染诱导宿主细胞isomiRNA的产生
4.4 JEV对 pri-、pre-、mature-miRNA表达的调控
4.5 JEV NS3降解宿主miRNA的表达
4.6 JEV NS3与miRNA的结合情况
4.7 JEV NS3与miRNA结合位点突变对miRNA表达的影响
4.8 黄病毒科病毒NS3对miRNA表达的调控
5 讨论
5.1 病毒感染对宿主miRNA表达的调控方式
5.2 黄病毒属病毒解旋酶对miRNA表达的调控
5.3 RNA结合蛋白对miRNA表达的影响
5.4 pre-miRNA 高通量测序分析黄病毒属病毒NS3对miRNA表达的调控
6 结论
参考文献
附录
致谢
攻读学位期间的学术成果