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寨卡病毒通过靶向MAVS和MITA蛋白逃逸宿主天然免疫 反应的机制研究

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目录

声明

中英文缩略词对照表

前言

1 实验材料与试剂

1.1 实验主要仪器与设备

1.2 实验材料

1.3 主要实验试剂

1.4 主要溶液配制

1.4.1 1×PBS缓冲液

1.4.2 PEI转染试剂

1.4.3 RIPA裂解液

1.4.4 DMEM细胞完全培养基(500ml)

1.4.5 细胞冻存液(10ml)

1.4.6 LB液态培养基(1L)

1.4.7 LB固态培养基(1L)

1.4.8 SOB培养基

1.4.9 10×Running Buffer

1.4.10 Trans Buffer(转膜液)

1.4.11 2×SDS蛋白上样缓冲液

1.4.12 ECL化学发光液

1.4.13 10×TBE缓冲液(1L)

1.4.14 1%琼脂糖凝胶溶液(20ml)

1.4.15 SDS-PAGE凝胶溶液配制相关的试剂

1.4.16 TBST缓冲液

1.4.17 感受态制备相关溶液

1.4.18 甲基纤维素溶液

1.4.19 1%结晶紫溶液

2 实验方法

2.1贴壁细胞的复苏、传代与冻存

2.2 病毒的培养和滴度测定

(2) 病毒滴度测定

2.3 SH-SY5Y细胞上清中寨卡病毒滴度测定

2.4真核表达载体构建实验

(1) PCR扩增目的基因

(2) 双酶切法线性化克隆载体

(3)连接目的基因和载体(详见诺唯赞ClonExpress IIOne Step Cloning Kit)

(4) 反应产物转化

(5) 涂板

(6) 克隆鉴定(菌落PCR法)

(7) 测序

(8) 质粒提取(参照天根生化科技有限公司的无内毒素大提试剂盒说明书)

2.5 点突变体构建

(3) DpnI消化模板质粒DNA

(4)取5μl反应液转化、涂板、挑菌、测序

2.6 细胞转染

2.7 RT-PCR实验

(1) RNA提取(Trizol裂解法)

(2) 逆转录PCR反应 (详见诺唯赞R223-01说明书)

(3) qPCR反应

2.8Western Blot实验

(1)总蛋白提取(冰上操作)

(2) 细胞中胞浆、胞核蛋白的提取(详见康维世纪Nc-细胞核/浆蛋白抽提试剂盒)

(3) SDS-PAGE电泳

(8)蛋白质条带检测

2.9 免疫共沉淀实验

(1)总蛋白提取

(2)免疫沉淀

(3)样本分析

2.10 泛素化实验

2.11 免疫共聚焦实验

2.12 双荧光素酶报告实验

2.13 DH5α感受态制备

2.14 数据统计与结果分析

3 实验结果

3.1 SZ-WIV01寨卡病毒株显著抑制I型干扰素的产生

3.2 SZ-WIV01寨卡病毒株通过其非结构蛋白NS3和NS2B3来拮抗I型干扰素的产生

3.2.1 SZ-WIV01病毒蛋白质粒的真核表达验证

3.2.2 NS3和NS2B3可显著抑制poly(I:C)诱导的IFNβ及ISGs表达

3.2.3 NS3和NS2B3干扰poly(I:C)诱导的IRF3蛋白核易位

3.3. NS3和NS2B3分别通过靶向并结合MAVS和MITA蛋白来负向调控IFNβ表达

3.3.1 NS3干扰MAVS或其上游蛋白诱导的IFNβ表达,而NS2B3则作用于MITA或其上游

3.3.2 NS3和NS2B3分别与MAVS和MITA发生蛋白相互结合

3.4. NS3-MAVS,NS2B3-MITA相互作用区域研究

3.4.1 MAVS/MITA与NS3/NS2B3截短体相互作用区域研究

3.4.2 NS3/NS2B3与MAVS/MITA截短体相互作用区域研究

3.5. NS3和NS2B3分别特异性的下调MAVS和MITA蛋白的表达

3.5.1 SZ-WIV01病毒抑制细胞中MAVS和MITA的蛋白表达

3.5.2 NS3和NS2B3分别抑制MAVS和MITA蛋白的表达

3.5.3 NS3和NS2B3分别在蛋白水平而非mRNA水平干扰MAVS和MITA的表达

3.5.4 NS3及NA2B3蛋白存在下MAVS和MITA降解速率探究

3.5.5 NS3对MAVS及NS2B3对MITA的蛋白表达调控依赖于蛋白间的相互结合

3.5.6 NS3及NS2B3对MAVS和MITA各个截短体蛋白表达的影响

3.6. NS3和NS2B3主要依赖蛋白酶体系统来降解MAVS和MITA

3.7. NS3、NS2B3对MAVS或MITA蛋白泛素化翻译后修饰的影响

3.7.1 NS3和NS2B3分别通过催化MAVS和MITA的K48泛素化修饰来促进其降解

3.7.2 NS2B3通过抑制MITA的K63泛素化修饰来抑制RLRs通路的信号传导

3.7.3 NS3和NS2B3对MAVS和MITA蛋白其他泛素化修饰类型的影响

讨论

参考文献

附表

综述:寨卡病毒研究进展

参考文献

研究生期间文章发表情况

致谢

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著录项

  • 作者

    李文娇;

  • 作者单位

    华中科技大学;

  • 授予单位 华中科技大学;
  • 学科 生物化学与分子生物学
  • 授予学位 博士
  • 导师姓名 曹轩;
  • 年度 2019
  • 页码
  • 总页数
  • 原文格式 PDF
  • 正文语种 中文
  • 中图分类
  • 关键词

    病毒; 靶向; 蛋白; 逃逸; 宿主; 天然免疫; 反应;

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