强直性脊柱炎全基因组连锁分析和TNF-α启动子区多态性研究

摘要

第一部分 强直性脊柱炎全基因组连锁分析寻找致病相关基因研究
　　 背景和目的：
　　 强直性脊柱炎(ankylosing spondylitis，AS)是一种常见的慢性、炎症性风湿性疾病。它主要侵犯人体中轴骨关节系统以及外周大关节，是一种慢性进行性自身免疫性疾病，其特征性病理改变是肌腱和韧带附着点的慢性炎症，多见于青壮年，男性发病较早且一般病情严重，是青壮年致残的因素之一。目前AS确切致病因素还不清楚。考虑主要是由遗传因素和环境因素共同作用的结果。
　　 本研究拟采用定位克隆法(全基因组扫描)，通过5个家系微卫星全扫结果的连锁综合分析，寻找与AS致病相关的基因连锁的区域。
　　 方法：
　　 对5个AS家系的127例个体进行微卫星(要把采用的主要试剂，仪器写上)全家系扫描，通过遗传连锁分析将疾病相关基因定位于某一区域，综合5个家系全扫的结果，进行异质性检验，以寻求最可能与AS致病基因相连锁的区域。
　　 结果：
　　 微卫星全扫初步使用LINKAGE分析数据在各个家系不同位点均有LOD值＞1的情况存在，其中标记D2S369(θ=0)有意义的最高LOD值为3.45。综合分析结果，只有6号染色体短臂上的标记D6S276在5个家系中均有正值，其异质性检验得到的hLOD值为13.47(P＜0.005)。
　　 结论：
　　 全基因组微卫星连锁分析结果显示，标记位点D6S276与AS之间存在显著的连锁关系，该区除了B27与AS发病与发展的相关已受关注之外，TNF-α基因坐落在该易感基因区域，值得进一步研究。
　　 第二部分 AS患者TNF-α启动子多态性与 TNF-α拮抗剂疗效基因药效学研究
　　 背景和目的：
　　 随着TNF-α在AS发病机制中的作用的研究深入和TNF-α拮抗剂在临床上广泛应用得到有效性资料，作为6号染色体上临近B27的基因之一，TNF-α基因的调控日益受到关注。有研究表明TNF-α启动子区域单核苷酸多态性与AS存在一定的关系，并且启动子区的单核苷酸多态性可能与TNF-α基因的表达和功能存在某种关联，而对TNF-α基因表达的影响与TNF-α拮抗剂的治疗的有效性是否相关还欠缺研究。本研究拟分析TNF-α基因启动子区8个已知单核苷酸多态性与中国汉人群的AS相关性并探讨不同基因型与患者对TNF-a拮抗剂疗效的关系。
　　 方法：
　　 对使用TNF-α拮抗剂治疗6周以上的127例AS患者和168例健康志愿者对照组的TNF-α启动子区约1300bp的片段进行PCR扩增，基因测序。以了解中国南方人群TNF-α基因启动子区8个已知SNP位点在AS患者与健康志愿者之间的差异。并分析启动子区SNPs连锁不平衡和单倍型情况，结合临床资料分析基因型与TNF-α拮抗剂疗效之间的关联性。
　　 结果：
　　 1.启动子区已知SNP位点中rs1799964(-1031C/T)，rs1800630(-863A/C)和rs1799724(-857C/T)位点的各基因型频率分布在AS病例组和健康对照组之间存在差异，其中-857C/T有显著统计学意义(P＜0.005)。
　　 2.通过连锁不平衡分析考虑rs1799964，rs1800630，rs1799724和rs1800629这四个SNP位点之间存在连锁关系。单倍型分析发现TCTGGGGG和TCTGGAGG这两种单倍型在AS病例组的频率明显高于健康对照组(P＜0.005)。
　　 3.-857TT纯合子较CT杂合子对TNF-α抑制剂6周治疗后的BAISFI、CRP和BAS-G改善更显著(P＜0.05)。
　　 结论：
　　 1.TNF-α的启动子区的rs1799724(-857T)与中国南方人AS发病相关。
　　 2.-857TT纯合子AS患者对TNF-α拮抗剂临床治疗效果优于携带-857CT杂合子基因型的AS患者。

目录

文摘

英文文摘

论文说明：主要英文缩略词表

声明

前言

第一部分全基因组微卫星扫描

材料与方法

结果

讨论

小结

第二部分TNF-α启动子区多态性与TNF-α拮抗剂有效性相关研究

材料与方法

结果

讨论

小结

参考文献

致谢