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人参锈腐病菌诱导生防甲基营养型芽孢杆菌NJ13的转录组测序及分析

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第一章 绪论

1.1人参锈腐病研究概况

1.2 甲基营养型芽孢杆菌研究概况

1.3 RNA-Seq 技术研究进展

1.3.1 转录组学的研究方法

1.3.2转录组学的研究概况

1.4利用转录组研究植物与病原菌互作发展情况

1.5利用转录组研究植物与病毒互作发展情况

1.6病原真菌与生防细菌互作研究进展

1.7 实时荧光定量 PCR 技术

1.7.1 qRT -PCR 技术原理

1.7.2 qRT-PCR方法

1.7.3 qRT-PCR在植物病害方面的应用现状

1.8 基因克隆技术概况

1.9 研究路线与研究意义

1.9.1 技术路线

1.9.2 研究意义

第二章 生防菌NJ13对人参锈腐病菌抑制作用显微观察

2.1试验材料

2.1.1菌株

2.1.2主要培养基

2.1.3仪器和试剂

2.2试验方法

2.2.1 NJ13对DQX01孢子萌发抑制作用显微观察

2.3.1 NJ13对DQX01孢子萌发抑制作用显微观察

2.3.2显微观察NJ13对DQX01孢子萌发的抑制效果

2.4 小结

第三章 人参锈腐病菌诱导NJ13的转录组测序及数据分析

3.1 试验材料

3.1.1试验所需菌株同2.1.1;试验所用主要培养基同2.1.2

3.1.2 仪器设备

3.2 试验方法

3.2.1 样品制备

3.2.2 转录组测序

3.2.3测序流程

3.2.4 测序数据生物信息学分析

3.3 结果与分析

3.3.1 测序数据处理

3.3.2基因表达水平分析

3.3.3 差异表达基因的分析

3.3.4 差异基因GO功能分类

3.3.5差异表达基因的KEGG Pathway代谢通路分析

3.4 小结

第四章 转录组测序结果验证

4.1 试验材料

4.1.1 试验所用培养基及培养条件

4.1.2试验所用主要试剂及仪器

4.1.3实验所用菌株及质粒

4.2 试验方法

4.2.1 qRT–PCR验证

4.2.2 克隆验证方法

4.3结果与分析

4.3.1 qRT–PCR结果与分析

4.3.2 克隆验证结果与分析

4.4 小结

第五章 结论与讨论

5.1 结论

1. 生防菌NJ13对锈腐病菌DQX01抑制作用显微观察

2. 锈腐病菌诱导下生防菌NJ13的转录组测序及数据分析

3. 转录组测序结果验证

5.2 讨论

参考文献

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