柴达木绒山羊遗传多样性及部分绒性状分子标记研究

摘要

本研究以柴达木绒山羊为研究对象，利用微卫星标记对8个位点进行遗传多样性分析；同时选取4个角蛋白辅助蛋白(KAP)基因，利用PCR-SSCP标记其作为候选基因选择绒细度和产绒量的可行性。 选取的8个微卫星位点，均得到特异性扩增结果，共检测到59个等位基因，平均每个位点达7.375个。其中BM3413和L,SCV24等位基因最多，各检测出9个：MAF-70和ILSTS082各检测出8个：BM3033检测出7个；LSCV13、BM1227和BM4037各检测出6个，所有的位点等位基因数皆大于或等于5。8个微卫星位点在柴达木绒山羊上均呈高度的多态性(PIC>0.5)，位点LSCV24基因杂合度、有效等位基因和多态信息含量均最高(H=0.796,N=6.916，PIC=0.766)；位点BM3413的基因杂合度、多态信息含量均最小(H=0.676，PIC=0.615)；位点MAF-70的有效等位基因数最小(N=0.7672)。微卫星标记平均杂合度为0.733和平均多态信息含量为0.688，表明柴达木绒山羊遗传背景复杂，遗传多样性丰富。 对4个KAP基因位点绒细度性状的标记效应进行F检验和多重比较，发现S3和S4两位点各基因型间的最小二乘均值差异不显著(P>0.05)；S1位点AB基因型(LSM=15.852)显著高于AA和BB基因型(LSMBB=15.849，LSMAA=15.841)(P<0.05)；S2位点AA基因型(LSM=16.003)显著高于AB和BB基因型(LSMAB=15.193，LSMBB=15.876)(P<0.05)。表明S1位点AB基因型和S2位点AA基因型可能为绒细度首选的标记基因型。 对4个KAP基因位点绒重性状的标记效应进行F检验和多重比较，发现S1和S3两位点各基因型的最小二乘均值间差异均不显著(P>0.05)；S2位点AB基因型(LSM=520.045)显著高于AA基因型(LSM=464312)和BB基因型(LSM=433.136)(P<0.05)；S4位点AA基因型(LSM=465.423)和BB基因型(LSM=461.365)显著高于AB基因型(LSM=433.082)(P<0.05)。表明S2位点AB基因型和S4位点AA，BB基因型可能为绒重性状首选的标记基因型。 S1位点与绒细度的遗传相关(rBO=0.923437)、S2位点与绒重的遗传相关(rBG=0.968438)均最大；S2位点与绒细度的遗传相关(rBG=0.146687)、S4位点与绒细度的遗传相关最小(rBG=0.356966)均最小。表明S1位点可能为绒细度候选基因的主效基因，S2位点可能为绒重性状候选基因的主效基因。

目录

文摘

英文文摘

声明

第一章文献综述

1绒山羊育种研究进展

1.1绒山羊生产概况

1.2绒山羊品种、分布及生产性能

1.3绒山羊育种方法研究进展

2柴达木绒山羊概况

2.1柴达木盆地基本概况

2.2柴达木绒山羊的发展现状

3微卫星标记和PCR-SSCP技术及其在动物育种中的应用

3.1分子标记概况

3.2微卫星标记技术

3.3 PCR-SSCP技术

3.4两种标记技术在动物遗传育种中的应用

4本研究的目的意义

第二章材料和方法

1试验材料

1.1试验动物和地点

1.2仪器及试剂

1.3主要的化学药品及耗材

1.4主要溶液的配制

2试验方法

2.1基因组DNA的提取

2.2基因组DNA浓度和纯度的检测

2.3分子标记检测

2.4 PCR产物琼脂糖及非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳

3统计与分析

3.1基因频率、基因型频率的计算和检验

3.2群体杂合度、多态信息含量和有效等位基因数的计算

3.3各位点基因型经济性状LSM和LSE的数学模型

3.4遗传方差分析

第三章结果与分析

1基因组DNA的检测

2柴达木绒山羊微卫星遗传多样性分析

2.1微卫星位点电泳检测

2.2柴达木绒山羊微卫星遗传多样性分析

2.3 PCR-SSCP电泳检测

3柴达木绒山羊羊绒细度性状标记和绒重性状标记基因型效应分析

3.1柴达木绒山羊羊绒细度性状标记基因型的效应分析

3.2柴达木绒山羊绒重性状标记基因型的效应分析

3.3柴达木绒山羊羊绒细度和绒重性状标记位点的遗传方差组分

第四章讨论

1样本含量

2血样的处理与保存

3关于群体的遗传变异

4绒山羊经济性状标记位点和基因型的效应

4.1绒山羊经济性状标记基因型效应

4.2绒山羊经济性状标记位点效应

4.3标记辅助选择存在的问题

第五章结论

参考文献

致谢

作者简历

导师简介