金华猪六个基因座位的检测及其对繁殖性效应的分析

摘要

本试验采用PCR-RFLP方法分析了金华猪Ⅰ、Ⅱ和Ⅲ系的酸肉基因(RN)、黑素皮质激素受体-4基因(MC4R)、半胱氨酸蛋白酶抑制剂B基因(CSTB)、生长激素基因(GH2)和肌细胞生成素基因(MyoG)的多态性,采用PCR-SSCP方法分析了金华猪Ⅰ、Ⅱ和Ⅲ系的组织蛋白酶B基因(CTSB)的多态性,然后应用SPSS统计软件对RN、MC4R、CTSB、GH和MyoG(PCR-1)五个基因座位与金华猪Ⅰ系和Ⅲ系的繁殖性状(产活仔数(numberborn alive,NBA)、总产仔数(total number born,TNB)和初生窝重(littler weight at birth,BLW))的关系进行了分析,结果如下:CSTB(CysB-2)、CSTB(CysB-3)和MyoG(PCR-2)三个基因座位是单态的,RN、CTSB、MC4R、GH和MyoG(PCR-1)五个基因座位是多态的,它们在Ⅰ系中的多态性高于Ⅱ系和Ⅲ系;全群中RN-的基因频率为0.2834;GH基因的allele A的频率为0.5146;MyoG(PCR1)座位的allele A频率为0.3456;CTSB基因的allele 3的频率为0.0079,但其在Ⅲ系中没有出现.由数据分析可得,RN、MC4R、CTSB和GH四个基因以及RN基因和GH基因的互作效应对金华猪的繁殖性状有显著影响.MC4R基因在初产胎次中对金华猪的NBA影响极显著(P<0.01),在经产胎次中对金华猪NBA影响显著(P<0.05),对金华猪TNB和BLW影响不显著(P>0.05);MyoG(PCR1)基因座位对金华猪所有胎次的TNB、NBA和BLW影响都不显著(P>0.05);CTSB基因对金华猪所有胎次的TNB影响显著(P<0.05),对所有胎次的NBA及BLW的影响都不显著(P>0.05);GH基因对金华猪经产胎次的NBA、TNB和BLW影响极显著(P<0.01),对初产胎次和二胎的NBA、TNB和BLW影响不显著(P>0.05);在经产胎次中,RN基因对金华猪的TNB和NBA有极显著影响(P<0.01),对金华猪所有胎次的BLW影响不显著(P>0.05).MyoG(PCR-1)座位和GH座位的互作效应对金华猪经产胎次的BLW影响极显著(P<0.01),对所有胎次的TNB和NBA以及初产胎次和二胎的BLW的影响不显著(P>0.05);RN基因和GH基因对金华猪的繁殖性状有互作效应;RN基因和MyoG(PCR-1)座位的互作效应对金华猪所有胎次的NBA、TNB和BLW影响不显著(P>0.05);RN基因和GH基因的互作效应对金华猪经产胎次的NBA、TNB和BLW以及初产胎次的BLW的影响极显著(P<0.01),对金华猪初产胎次和二胎的NBA和TNB以及二胎的BLW影响不显著(P>0.05).RN、MC4R、GH和MyoG(PCR1)四个座位对金华猪繁殖性状(NBA、TNB和BLW)的加性效应与胎次有关.

目录

文摘

英文文摘

资助

第一章文献综述

1.1猪酸肉基因(RN)的研究进展

1.1.1基因的效应

1.1.2基因分布

1.1.3基因多态性及其等位基因的频率估计

1.1.4定位

1.2黑素皮质素受体(melanocortin receptors MCRs)基因的研究进展

1.2.1 MCRs简介

1.2.2阿黑皮质素原(POMC)

1.2.3中枢黑素皮质素系统(the central melanocortin system，CMS)

1.2.4 CMS调控能量平衡的机制

1.2.5猪MC4R基因的PCR-RFLP

1.3 CTSB和CSTB基因的研究进展

1.3.1 CTSB和CSTB基因简介

1.3.2 CTSB和CSTB基因的多态性及其等位基因频率分布

1.3.3基因定位

1.4 MyoG基因研究进展

1.5 GH基因研究进展

1.5.1猪生长激素基因的结构特点和多态性研究

1.5.2生长激素的结构特点

1.5.3猪生长激素的生理功能

1.6基因序列

1.6.1 RN gene

1.6.2 MC4R gene

1.6.3 Allele 1 ofCTSB gene

1.6.4 Allele 1 ofCSTB gene(CysB-3)

1.6.5 GH gene

1.6.6 MyoG(PCR-1)1ocus

1.6.7 MyoG(PCR-2)1ocus

1.7 PCR-RFLP

1.7.1 PCR-RFLP标记分类

1.7.2 RFLP标记的特点

1.8 PCR-SSCP

1.8.1 PCR-SSCP的建立与发展

1.8.2聚丙烯酰胺凝胶的制备

1.8.3 PCR-SSCP的特点

1.9金华猪简介及其研究的意义

1.9.1分类

1.9.2肉质特性

1.9.3繁殖特性

1.9.4开展金华猪肉质和繁殖性状分子生物学研究的意义

第二章材料与方法

2.1血样的采集与处理

2.2试剂

2.2.1基因组DNA抽提试剂

2.2.2 PCR式剂

2.2.3酶切试剂及电泳试剂

2.3溶液的配制

2.3.1 0.5 M的EDTA-Na2(pH8.0)的配制

2.3.2 Tris-HCl缓冲液母液的配制

2.3.3裂解液的配制

2.3.4酶解反应液的配制

2.3.5提纯溶液的配制

2.3.6 PAGE用试剂的配制

2.3.7其他试剂的配制

2.4琼脂糖凝胶的制备

2.5聚丙烯酰胺凝胶的制备及其电泳

2.5.1试验准备

2.5.2制备胶室

2.5.3配胶

2.5.4灌胶和装胶

2.5.5变性、加样和电泳

2.5.6取胶、固定与染显色

2.6仪器没备

2.7生产性能各项指标的获得及表型资料的收集

2.8研究方法

2.8.1基因组DNA的抽提

2.8.2基因组DNA检测

2.8.3 PCR扩增反应条件和酶切反应条件

2.8.4电泳检测分析

2.9统计分析

2.9.1基因型频率及基因频率的计算

2.9.2基因效应的统计分析

第三章结果与分析

3.1基因扩增及酶切分析结果

3.1.1 RN基因

3.1.2 MC4R基因

3.1.3 CSTB基因

3.1.4 CTSB基因

3.1.5 MyoG基因

3.1.6 GH基因

3.2基因型和基因频率

3.2.1 RN基因

3.2.2 MC4R基因

3.2.3 CSTB基因

3.2.4 MyoG基因

3.2.5 CTSB基因

3.2.6 GH基因

3.3各基因对繁殖性状的影响

3.3.1 RN基因对繁殖性状的效应

3.3.2 MC4R基因对繁殖性状的效应

3.3.3 CTSB基因对繁殖性状的效应

3.3.4 GH基因对繁殖性状的效应

3.3.5 MyoG(PCR1)基因对繁殖性状的效应

3.4基因互作效应对繁殖性状的影响

3.4.1 RN基因和MyoG(PCR1)基因的互作效应对繁殖性状的影响

3.4.2 RN基因和GH基因的互作效应对繁殖性状的影响

3.4.3 GH基因和MyoG(PCR1)基因的互作效应对繁殖性状的影响

第四章讨论

4.1各基因在群体中分布及其与相关性状的关系

4.2各基因对繁殖性状的影响

4.3方法的讨论

4.4品种改良的建议

第五章结论

参考文献(references)

致谢