污水、海洋环境厌氧微生物的分离与YJ1菌株的初步研究

摘要

采用Hungate滚管法，对浙江慈溪榨菜废水、富阳造纸厂废水、4个不同深度的南海沉积物的7个样品进行厌氧微生物的分离和纯化，共得到二十多株厌氧微生物菌株。基于16SrRNA基因序列分析，分别属于梭菌属(Clostridium)、脱硫肠状菌属(Desulfotomaculum)、气球菌属(Aerococcus)，变形杆菌属(Proteus)，硫酸盐还原菌属(Anaerofilum)，涅瓦菌属(Nevskia)，无胆甾原体属(Acholeplasma)，类芽孢杆菌(Paenibacillus)，芽孢杆菌属(Bacillus)，丛毛单胞菌属(Brachymonas)和盐厌氧菌(Geosporobacter)，瘤胃球菌属(Ruminococcus)等12个属。共获得8株疑似新种的微生物，并对其中一株分离自浙江慈溪榨菜废水的疑似新种YJ1菌株进行了16SrRNA基因的克隆与序列分析，其GenBank序列号为HQ917002。通过EzTaxonserver2.1网站的在线比对工具进行比对，菌株YJ1TTA克隆得到的序列与瘤胃球菌属(Ruminococcus)的属内成员的16SrRNA基因序列最高相似性为89.8％，并进行了初步的分析研究。

目录

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摘要

第一章 文献综述

1．1 厌氧菌及其基本分类

1．1．1 嗜热厌氧菌及其分类

1．1．2 嗜碱厌氧菌及其分类

1．1．3 嗜盐厌氧菌及其分类

1．1．4 按氧需求所进行的厌氧菌的分类

1．2 硫酸盐还原菌的生理生化机制研究与生物工程应用以及前景展望

1．3 厌氧技术在污水处理中的地位

第二章 环境中的微生物分离

2．1 引言

2．2 材料和方法

2．2．1 分菌的样品来源

2．2．2 实验室仪器和设备

2．2．3 实验主要试剂

2．2．4 厌氧操作技术

2．2．5 厌氧菌株纯化技术

2．2．6 分离菌株使用的培养基

2．2．7 菌株的分离

2．2．8 菌株的甘油保藏和冷干保藏

2．2．9 基因组的大量提取

2．2．10 基因组的少量提取方法

2．2．11 16S rRNA序列PCR扩增

2．2．12 序列比对方法

2．2．13 关于菌株的TA克隆

2．2．14 G+Cmol％的测量

2．3 几种样品厌氧菌的分离结果

2．4 分菌结果的相关讨论

第三章 菌株YJ1的多相分类学研究

3．1 引言

3．2 材料与方法

3．2．1 分离样品以及培养基

3．2．2 实验仪器和设备

3．2．3 细菌的表型特征分析

3．3 结果与讨论

3．3．1 形态特征

3．3．2 基于16sRNA构建的系统发育树

3．3．3 生长特征

3．3．4 底物利用结果

3．3．5 电子受体实验

3．3．6 发酵产物实验

3．3．7 生理生化实验

3．3．8 GC mol％含量

3．4 关于YJ1的新种鉴定总结

第四章 实验结果分析与讨论

4．1 关于分菌

4．2 关于YJ1的多相分类学研究

参考文献

攻读学位期间发表的论文

致谢