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致谢
摘要
缩略语表
1 绪论
1.1 梨属植物系统发育、亲缘关系与起源研究进展
1.1.1 梨属植物起源和地理分布
1.1.2 梨属植物的基本种及形态分类
1.1.3 梨属品种演化
1.1.4 基于DNA分子标记和序列的梨属植物系统发育与亲缘关系研究
1.2 反转录转座子研究进展
1.2.1 植物反转录转座子类型
1.2.2 植物反转录转座子的结构特征
1.2.3 LTR反转录转座子的活性及影响因素
1.2.4 基于反转录转座子的标记开发及利用
1.3 立题依据与研究内容
2 梨反转录转座子预测及功能元件分析
2.1 材料与方法
2.1.1 试验材料
2.1.2 反转录转座子预测
2.1.3 反转录转座子插入时间分析
2.1.4 反转录转座子侧翼区域基因分析
2.1.5 梨反转录转座子转录分析
2.1.6 反转录转座子内部元件预测及分析
2.1.7 逆转录酶半定量分析
2.2 结果与分析
2.2.1 梨反转录转座子预测
2.2.2 梨反转录转座子的分类
2.2.3 梨属植物中反转录转座子插入时间
2.2.4 梨属植物中反转录转座子转录分析
2.2.5 梨属植物中反转录转座子侧翼区域基因注释
2.2.6 反转录转座子逆转录酶预测
2.2.7 逆转录酶的系统进化分析
2.2.8 不同支系逆转录酶序列分析
2.2.9 梨属植物中逆转录酶PCR扩增及半定量分析
2.3 讨论
2.3.1 梨反转录转座子预测
2.3.2 梨反转录转座子插入时间预测
2.3.3 逆转录酶进化分析
2.3.4 反转录转座子转录分析
3 RBIP标记开发及其在梨属植物亲缘关系研究中的应用
3.1 材料与方法
3.1.1 试验材料
3.1.2 RBIP标记开发
3.1.3 PCR扩增和结果分析
3.1.4 数据处理
3.2 结果与分析
3.2.1 梨样品DNA提取与检测
3.2.2 RBIP标记开发
3.2.3 RBIP标记在梨属种中扩增
3.2.4 梨属亲缘关系研究
3.3 讨论
3.3.1 反转录转座子分布和RBIP标记特征
3.3.2 梨属亲缘关系
3.3.3 杂种起源
3.3.4 梨属同物异名鉴定
4 SSAP标记开发及其在亚洲梨亲缘关系及品种起源研究上的应用
4.1 材料与方法
4.1.1 试验材料
4.1.2 标记开发
4.1.3 双酶切反应
4.1.4 连接
4.1.5 预扩增
4.1.6 选择性扩增
4.1.7 数据处理
4.2 结果与分析
4.2.1 SSAP标记多态性
4.2.2 亚洲梨基因库组成
4.2.3 亚洲梨基因库地理分布
4.2.4 亚洲梨亲缘关系
4.3 讨论
4.3.1 SSAP标记特征
4.3.2 亚洲梨基本种
4.3.3 亚洲梨种间杂交事件
4.3.4 亚洲梨种群中的自然杂交种
4.3.5 川梨起源与迁移
5 结论与展望
5.1 结论
5.1.1 梨属反转录转座子
5.1.2 逆转录酶
5.1.3 梨属植物亲缘关系和品种分化
5.2 展望
5.2.1 梨属植物分类
5.2.2 亚洲可疑杂交种的起源与品种演化研究
5.2.3 梨属反转录转座子研究
参考文献
附表
作者简历