水稻第6染色体短臂剑叶长度QTL的分解和精细定位

摘要

水稻叶片形态的遗传改良是增加水稻产量的有效途径，叶片的形态特征，如剑叶长度，是多基因控制的复杂数量性状。在前期研究中，利用珍汕97B和密阳46构建的重组自交系群体对叶片形态性状进行QTL定位，将控制水稻叶片相关性状的QTL定位在第6染色体短臂RM317-RZ516区间。本研究选取在第6染色体短臂目标区间8个多态性标记和其它区间18个多态性标记，检测珍汕97B和密阳46重组自交系群体461个F7株系的每个单株，筛选出1个在RM587-RM402区间（约4.2Mb）呈杂合，在其他区间呈纯合的单株（1-173）。并由该单株衍生了1套由221个株系组成的F2:3群体。进而通过标记筛选，挑选在第6染色体目标区间的剩余杂合体（RHLs）。2006年和2007年分别在该区间构建了3套和7套交迭的近等基因系材料，进行精细定位。主要结果如下：
　　1、2006年，种植覆盖目标区域RM587-RM402的3套近等基因系材料（RHL6-4、RHL6-7和RHL6-10），应用SAS软件一般线性模型(Proc GLM)分析叶片性状数据，经等位基因效应分析，在RHL6-4、RHL6-7两套群体中，三种基因型株系之间存在显著的差异，而在RHL6-10中差异不显著。由此推测，目标区间中控制剑叶长度的QTL位于RM190-RM6119之间，表型贡献率分别为28.63％和76.35%，加性效应分别为-4.08cm和-8.33cm。这个结果验证了前期初定位的结果，同时，控制剑叶周长、叶面积、叶长宽比以及倒二叶、倒三叶的部分形态性状的QTL也定位在此区间。
　　经交迭重组染色体片段代换系分析，在第6染色体短臂区间可能存在2个控制剑叶长度的QTL。分别位于RM190-RM204和RM510-RM6917区间，全部表现为加性效应，其中1个增效等位基因来自父本密阳46，另外1个来自母本珍汕97B。控制剑叶周长、叶面积、长宽比以及倒二叶长度、周长、叶面积、长宽比等多个性状QTL的分解与此相同。
　　2、2007年，种植异质区间分别为RM19350-RM5815和RM190-RM6119的7套阶梯式QTL近等基因系，应用SAS软件一般线性模型(Proc GLM)分析剑叶长度数据，将控制剑叶长度的qFLL6.1定位到RM19350-RM19390的739.5kb区间，增效等位基因来源于密阳46，加性效应为1.46cm。将qFLL6.2定位到RM3414-CG68266的62.3kb区间，增效等位基因来自珍汕97B，加性效应为-2.40cm，表型贡献率为52.73%。
　　通过基因序列的比对，RM3414-CG62132区间共有7个候选基因，进一步的工作需要将目标区间缩小到1-2个候选基因的区域，然后进行基因的克隆、表达以及表达后的功能分析。

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引 言

第一章 文献综述

1.1. QTL定位研究

1.2. 水稻叶片形态因子的QTL定位

1.3. 水稻QTL的精细定位

1.4. 本研究的目的和意义

第二章 RM587-RM402区间内水稻叶片性状QTL的遗传验证与分解

2.1.引 言

2.2.材料和方法

2.3.结果与分析

2.4.讨 论

第三章 第6染色体短臂剑叶长度QTL的精细定位

3.1. 引 言

3.2. 材料和方法

3.3. 结果与分析

3.4. 讨 论

第四章结论及进一步的研究展望

4.1 结论

4.2 展望

参考文献

致谢