利用微卫星标记分析新疆地方斗鸡类群的遗传多样性

摘要

本试验利用8个微卫星座位分析了新疆三个地方(吐鲁番、喀什和伊犁)斗鸡类群的等位基因频率、多态信息含量、基因杂合度和有效等位基因数等群体遗传变异参数,研究结果如下： 1、每一微卫星座位的等位基因频率在不同类群之间存在着明显的差异,表现出等位基因在各类群中的分布不平衡性。8个微卫星位点共检测到77个等位基因,平均基因数为9.63个。 2、8个微卫星基因座中,MCW0157座位多态性晟丰富,平均遗传杂合度为0.8569,ADL0298座位多态性最差,平均遗传杂合度为0.6723。3个斗鸡类群中,吐鲁番斗鸡遗传杂合度最高(0.8255),伊犁斗鸡遗传杂合度最低(0.7874)。 3、8个微卫星座位在3个试验鸡中表现出较高的多态信息含量,均大于0.5,说明试验所用的8个微卫星座位均为高度多态,可作为有效的遗传标记用于鸡群体遗传多样性的分析。 4、所有类群间的平均遗传距离为0.2886(0.2051～0.3859),其中吐鲁番斗鸡和喀什斗鸡之间的Ds遗传距离最近为0.2051,伊犁斗鸡和喀什斗鸡之间的Ds遗传距离最远为0.3859。 5、运用SPSS13.0软件进行单因素方差分析并采用LSD法进行显著性检验(P<0.05表示差异显著,P<0.01表示差异极显著)分析新疆三个地方斗鸡的体尺性状的关系,发现吐鲁番斗鸡、喀什斗鸡和伊犁斗鸡在体尺方面差异显著或极显著。 综上所述,8个微卫星基因座多态信息含量丰富,适合作为新疆3个斗鸡类群的遗传标记,可用于其多样性评估、遗传距离分析、性状选育等研究领域。新疆3个斗鸡类群遗传多态性丰富,遗传变异较大,均具有较大的遗传潜力,可依据其特有的基因型选育出各具特色的新疆3个地区斗鸡新品种(系)。

目录

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第一篇文献综述

1.斗鸡的历史发展和研究现状

1.1我国斗鸡的历史及发展状况

1.2国外斗鸡的发展历史与现状

1.3吐鲁番斗鸡的历史及现状

2.群体遗传多样性的研究方法

2.1传统遗传标记

2.2 DNA分子标记

3.微卫星DNA结构、特性及应用

3.1微卫星DNA结构及特点

3.2微卫星位点多态性的形成机理

3.3微卫星位点的功能

3.4微卫星多态性的数据分析

4.微卫星标记在家禽遗传育种上的应用

4.1基因定位及构建基因组图谱

4.2群体遗传结构分析和群体间遗传距离

4.3与生产性状的连锁分析及数量性状位点(QTL)定位

4.4鉴定个体间亲缘关系

4.5监测育种和遗传操作效应

5.本实验研究的目的和意义

第二篇试验研究

1.材料和方法

1.1试验材料

1.2试验方法

1.3统计方法

2.结果与分析

2.1 DNA提取结果和PCR扩增产物检测

2.2扩增结果与多态性

2.3等位基因频率与遗传变异分析

2.4新疆三个地方斗鸡类群体重、体尺性状的比较

2.5微卫星标记与新疆三个地方斗鸡类群体重、体尺的相关性初探

3.讨论

3.1关于聚丙烯酰胺凝胶电泳和带型的判读

3.2关于种群内的遗传变异

3.3关于微卫星标记数目和试验群体大小的问题

4.结论

参考文献

致谢

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