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原发性肝癌中基因突变和变位剪接的初步研究

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目的:研究原发性肝癌中p53基因、β-catenin基因的表达及其突变;hTERT基因、DNMT3b基因在肝癌中的表达及其变位剪接的情况;观察这4个基因在肝癌发生发展中的作用。 方法:以我实验室提取的RNA的反转录产物为实验标本,取其中29份经PCR检测P53基因、18份检测β-catenin、38份检测DNMT3b基因、17份检测hTERT基因。PCR产物行凝胶电泳,回收后经T-A克隆转化测序,并行寡聚核苷酸芯片杂交,检测这四种基因的表达及突变情况。 结果:PCR结果显示β-catenin基因在85.7%(6/7)的肝癌、100%(11/11)的癌旁组织有表达,表达强度在肝癌组与癌旁组无差异(p>0.05)。p53基因在69.2%(9/13)的肝癌、81.3%(13/16)的癌旁组织中有表达,表达强度在两组无差异(p>0.05)。DNMT3b基因以四种变位剪接体(DNMT3b1、DNMT3b3、DNMT3b4、DNMT3b5)的形式表达,其总的表达率为肝癌组92.3%(12/13)、癌旁组71.4%(10/14)、正常及慢性肝病组90.9%(10/11)。三组表达无统计学差异。其中DNMT3b1在正常及慢性肝病组中的表达高于肝癌组(p<0.05)。DNMT3b4见于1例肝癌和1例癌旁组织,DNMT3b5见于1例肝癌组织,两者在正常及慢性肝病组均无表达。hTERT基因以四种变位剪接体(全长转录体、α剪接体、β剪接体及αβ剪接体)的形式表达,总的表达率为肝癌组90%(9/10)、癌旁组100%(4/4),正常及慢性肝病组66.7%(2/3),三组间表达无统计学差异。三组中,全长转录体在肝癌中表达率为66.7%,癌旁25%,正常及慢性肝病组0,虽无统计学意义,但有一个逐渐降低的趋势。DNA测序显示:β-catenin基因在肝癌中的突变率为0%(0/5),癌旁组中突变率为36.4%(4/11),两组无统计学差异(p>0.05)。突变位点在密码子14、72、80。p53基因在肝癌中突变率为66.7%(4/6),癌旁为50%(5/10),两组相比无统计学差异,突变位点位于密码子232、234、235、236、244、248、258、259、273、275、279、305,大部分位于p53的5个保守区。寡聚核苷酸芯片杂交结果显示在根据文献报道设计的常见的p53基因的突变位点均未检测到突变型杂交信号,与测序结果一致。DNMT及hTERT基因均检测到四种变位剪接体的杂交信号。 结论:β-catenin基因在肝癌中未见突变,是否存在其他激活Wnt途径的机制尚需进一步观察;p53基因在肝癌中的表达及突变率与文献报道结果一致,其突变位点位于常见的5个保守区内,可能与肝癌的发生有关。DNMT3b以四种变位剪接体的形式表达,DNMT3b1在正常及慢性肝病组中表达高于癌组织,对维持良性细胞DNMT活性起一定作用。hTERT以四种变位剪接体的形式表达,全长转录体在正常及慢性肝病组、癌旁、肝癌组的表达呈上升趋势,是否对肝细胞由正常向肝癌的转变起一定的作用,需进一步研究。

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