计算机辅助对一系列酶和蛋白质与其抑制剂的结合方式的研究

摘要

本文利用计算机辅助，对几种靶酶与其抑制剂小分子的结合情况进行了研究。 在受体乙酰乳酸合成酶(ALS)三维结构未知的情况下，采用距离比较法(DISCO)抽提出靶酶ALS抑制剂的药效团模型。 根据的菠菜光合作用系统Ⅱ的D1蛋白的氨基酸序列，利用其同源蛋白(细菌cyanobacteriumThermosynechococcuselongatus的光合系统Ⅱ的D1蛋白)的晶体结构，同源模建了菠菜D1蛋白的三维空间结构。 利用已建立的菠菜D1蛋白的3D结构和原卟啉原氧化酶(PPO)、对羟苯基丙酮酸双氧化酶(HPPD)的晶体结构，运用软件FlexX将各类蛋白质与其抑制剂小分子进行对接，研究了其结合方式。

目录

文摘

英文文摘

第一章绪论

第一节药效团的基本概念

第二节分子对接

第四节光合系统Ⅱ电子传递抑制剂的研究

第五节新型靶标HPPD抑制剂研究进展

第六节原卟啉原氧化酶(PPO)抑制剂的研究进展

第七节选题依据、设计思想、目的及意义

第二章计算部分

第一节靶酶ALS抑制剂药效团模型的建立

第二节菠菜光合系统Ⅱ中D1蛋白三维结构模型的建立

第三节运用F1ex X进行的分子对接

总结论

参考文献

致谢