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木瓜核基因组和线粒体基因组的拼接和初步分析

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第一章 引言

第一节 基因组及基因组计划概况

第二节 植物基因组测序现状

第三节 基因组测序技术

1.3.1 DNA测序原理

1.3.2 大规模测序的策略

1.3.3 全基因组鸟枪法与逐步克隆法

1.3.4 遗传图谱及SSR标记

1.3.5 物理图谱

1.3.6 全基因组鸟枪法测序策略

1.3.7 鸟枪法测序流程及序列拼接软件

第四节 线粒体基因组介绍

第五节 木瓜介绍

第六节 研究目标,内容及创新性

1.6.1 研究目标

1.6.2 研究内容

1.6.3 本项研究的创新性

第二章 材料和方法

第一节 实验材料

2.1.1 序列和注释

2.1.2 分析所用部分软件

2.1.3 前期工作

第二节 实验方法

2.2.1 木瓜线粒体基因组序列的注释

2.2.2 木瓜核基因组序列的拼接、核基因组序列注释结果的分析、核基因组序列和EST序列的提交

2.2.3 将木瓜基因组定位到连锁群

第三章 实验结果与分析

第一节 线粒体注释与分析

第二节 核基因组拼接结果

第三节 木瓜基因分析结果

第四节 整合物理图谱、遗传图谱和核基因组序列

第四章 讨论

第一节 物理图谱、遗传图谱和核基因组序列整合过程中的问题

第二节 线粒体基因组和核基因组的注释

第五章 结论

致谢

参考文献

个人简历

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摘要

木瓜是生长在热带亚热带地区的重要经济作物,具有很高的营养价值和药用价值。本文用Arachne程序将鸟枪法测序得到的

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