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摘要
第1章 绪论
1.1 决明的生物学特性
1.2 决明子的药理学作用
1.2.1 降血脂作用
1.2.2 降压作用
1.2.3 保肝作用
1.2.4 抑菌作用
1.2.5 对免疫系统作用
1.2.6 明目作用
1.2.7 其它作用
1.3 决明的生物活性成分
1.3.1 蒽醌
1.3.2 黄酮类
1.3.3 蛋白质和氨基酸
1.3.4 脂肪和脂肪酸
1.3.5 胰蛋白酶抑制剂
1.3.6 其它成分
1.4 决明的生物活性成分相关基因
1.5 转录组测序
1.6 本文的研究目的和意义
第2章 决明种子转录组学分析
2.1 材料与方法
2.1.1 植物材料
2.1.2 决明种子RNA的提取
2.1.3 转录组测序
2.1.4 序列组装
2.1.5 基因表达分析
2.1.6 基因功能注释、GO分类和代谢路径分析
2.1.7 SSR检测与引物设计
2.2 结果与讨论
2.2.1 决明种子RNA提取
2.2.2 决明种子转录组组装
2.2.3 基于对公共数据库检索的功能注释
2.2.4 决明转录组中蒽醌生物合成及调控相关基因
2.2.5 萜类生物合成基因
2.2.6 黄酮类化合物生物合成基因
2.2.7 脂类生物合成相关基因
2.2.8 脂转移蛋白
2.2.9 SSR
2.4 本章小结
第3章 决明定量PCR内参基因的选择与评价
3.1 材料与方法
3.1.1 植物组织的准备
3.1.2 生长激素和非生物胁迫
3.1.3 决明总RNA的提取与cDNA的制备
3.1.4 引物设计和标准曲线分析
3.1.5 qPCR扩增
3.1.6 决明候选内参基因稳定性分析
3.1.7 WRKY基因在不同组织和不同胁迫条件下的表达水平分析
3.2 结果与分析
3.2.1 RNA的提取
3.2.2 候选内参基因的选择和引物设计
3.2.3 决明内参候选基因的引物特异性与扩增效率
3.2.4 决明内参基因的初步筛选
3.2.5 决明内参候选基因的表达谱
3.2.6 内参候选基因表达稳定性分析
3.2.7 WRKY基因在不同决明组织以及不同胁迫条件下的表达水平分析
3.3 本章小结
第4章 决明胰蛋白酶抑制剂基因CoTI1的克隆、结构建模及功能鉴定
4.1 材料与方法
4.1.1 CoTI1的3’RACE
4.1.2 CoTI1 CDS全长克隆
4.1.3 CoTI1序列分析与分子建模
4.1.4 CoTI1原核表达载体的构建
4.1.5 CoTI1原核表达
4.1.6 CoTI1蛋白纯化
4.1.7 CoTI1活性检测
4.1.8 CoTI1定点突变
4.1.9 CbTI1表达模式分析
4.2 结果与讨论
4.2.1 CoTI1 cDNA的克隆
4.2.2 CoTI1氨基酸序列分析
4.2.3 CoTI1序列比对分析
4.2.4 CoTI1系统发育分析
4.2.5 CoTI1的结构建模
4.2.6 CoTI1与胰蛋白酶的相互作用分析
4.2.7 CoTI1原核表达载体的构建
4.2.8 CoTI1原核表达
4.2.9 CoTI1蛋白纯化
4.2.10 CoTI1原核表达蛋白的活性检测
4.2.11 CoTI1的定点突变
4.2.12 CoTI1的表达模式分析
4.3 本章小结
第5章 决明莽草酸激酶基因CoSK的克隆、结构建模和表达模式
5.1 材料与方法
5.1.1 CoSK的3’RACE
5.1.2 CoKS的5’RACE
5.1.3 CoSK的CDS全长克隆
5.1.4 CoSK序列分析与分子建模
5.1.5 CoSK表达模式分析
5.2 结果与讨论
5.2.1 CoSK的克隆和序列分析
5.2.2 CoSK氨基酸序列分析
5.2.3 CoSK系统发育分析
5.2.4 CoSK序列比对分析
5.2.5 CoSK的转运肽和亚细胞定位
5.2.6 CoSK分子建模
5.2.7 CoSK的不稳定性
5.2.8 CoSK和底物的相互作用分析
5.2.9 CoSK可能的催化机制
5.2.10 CoSK的组织表达模式
5.2.11 CoSK下游代谢产物的转运
5.3 本章小结
第6章 决明巴豆酰辅酶A羧化酶基因MCCase的克隆、序列分析和表达模式
6.1 材料与方法
6.1.1 决明MCCase的3’RACE
6.1.2 决明MCCase的5’RACE
6.1.3 决明MCCase的CDS全长克隆
6.1.4 决明MCCase的序列分析
6.1.5 决明MCCase的组织差异表达分析
6.2 结果与讨论
6.2.1 决明MCCase cDNA的克隆
6.2.2 决明MCCase氨基酸序列分析
6.2.3 决明MCCase系统发育分析
6.2.4 决明MCCase序列比对分析
6.2.5 决明MCCase三级结构预测
6.2.6 决明MCCase组织差异表达分析
6.3 本章小结
结论
参考文献
致谢
攻读硕士学位期间发表的学术论文及科研成果