狼疮易感基因PBX1单核苷酸多态性的筛选分析及其功能研究

摘要

【目的】对中国汉族人群系统性红斑狼疮（SLE）易感基因前B淋巴细胞白血病转录因子（PBX1）单核苷酸多态性位点进行筛选分析，并探讨阳性SNPs的生物学功能。 【方法】利用Taqman技术对PBX1基因内部29个SNPs和PBX1基因与微卫星标记D1S2628之间26个SNPs的243个家系样本进行基因分型，并用Haploview、FBAT、Genehunter软件进行家系连锁不平衡分析。利用3730基因测序技术对506名正常人和690名SLE患者标本进行rs3185695基因分型，进行病例对照研究。通过Real-time PCR、Pyrosequencing测序技术以及报告基因活性测定等方法分析PBX1基因3’UTR区SNP rs3185695对基因表达的影响。 【结果】通过家系连锁不平衡分析发现，有4个SNP（rs1038679，rs10753646，rs2488916，rs12082970 ）与SLE存在相关性，其中rs1038679，rs10753646位于PBX1 内含子区，rs2488916，rs12082970位于PBX1基因与微卫星标记D1S2628之间。中国汉族人群中rs3185695次要等位基因A在SLE患者组和正常对照组的频率分别为11.6％和7.4％，具有显著性差异，次要等位基因A与SLE发病相关。两种不同等位基因在mRNA水平表达量及其重组质粒报告基因活性存在明显差异，提示该位点的变异可能影响PBX1基因表达。 【结论】认为PBX1基因3’ UTR区的 rs3185695A与SLE发病关联，该SNP位点G→A的变异能增强其与microRNA-202的结合能力，促进PBX1基因在mRNA水平的降解作用，使基因表达水平下降，从而参与SLE的发生。