高通量测序技术在个性化医疗中的应用

摘要

高通量测序技术对于生物学研究来说是一次飞跃性的提高，它对于传统医学和疾病研究而言更是一次革命性的改变，特别是对未来个性化医疗的普及和发展起着非常关键的作用。本文从多个方面对高通量测序技术进行了介绍，通过比较高通量测序技术与其它技术在组织表达谱研究中的应用，从能检测到的基因总量、不同技术间的相关性、技术的灵敏性等多个方面，阐述了高通量测序技术相对于过去方法能检测到更多的基因和未知的转录本并且能检测到表达丰度很低的基因，具有更好的准确性、灵敏性和性价比，同时还提供了一种分析表达基因、基因表达相关性的技术框架以及一套肝脏和肾脏组织中表达基因的目录，为深入了解人体组织和疾病提供了宝贵的资源。接着，为高通量测序数据构建了一套方便使用、用户友好的通用分析平台，该平台能应用于研究人员非常关注的多种高通量测序应用领域，包括了重测序、ChIP-Seq测序等。随着高通量测序成本的不断降低以及测序数据的几何增长，通用数据分析平台的建立和完善对于更快、更方便地获取分析结果有着巨大的应用前景。最后，着重介绍了一个个性化突变数据库的建立，通过对各种已有数据库的收集、整理以及对多种突变检验和打分工具的使用，构建了一个较为全面的以人类DNA突变为核心的包含了各种突变相关信息的关系型数据库。同时在数据库的基础上，加入了个性化突变数据提交、存储和注释等功能，让用户可以方便地为自己个人的突变信息进行注释，从而更好地了解自身的健康情况等。全文的工作不仅系统地阐述了高通量测序技术在生物医学领域的应用，并且通过构建两套不同的平台，为全面分析了解高通量测序数据并挖掘数据背后的生物学意义提供了重要的技术和数据基础，为个性化医疗更好的应用提供了便利。随着高通量测序技术的继续发展和个性化医疗的不断普及，不但会给生命科学研究带来更多的资源和便利，也将对改善人类健康及生活质量起到巨大的作用。

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第一章 引言

1.1 DNA测序技术的发展

1.2主流高通量测序平台的介绍

1.3高通量测序技术的应用

1.4生物信息学在高通量测序领域中的应用

1.5高通量测序技术在个性化医疗领域中的应用前景

第二章 高通量技术在转录组学应用中的比较研究

2.1背景介绍

2.2数据来源及分析方法

2.3数据结果

2.4转录组研究的跨物种比较

2.5讨论

2.6结论

第三章 高通量测序数据通用分析平台的建立和应用

3.1背景介绍

3.2高通量测序数据通用分析流程的建立

3.3数据分析通用分析平台的构建及与相似软件的比较

3.4本章总结

第四章 个性化突变数据库的建立

4.1背景介绍

4.2突变数据库收集和整理

4.3突变数据库的建立

4.4个性化突变和SNP数据提交与检索

4.5本章总结

第五章 全文总结

参考文献

攻读博士学位期间已发表或录用的论文

攻读博士学位期间参与的科研项目

致谢

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