珠江野生鲮与养殖群体的遗传分析

摘要

鲮鱼（Cirrhina molitorella）属鲤形目（Cypriniformes），鲤科（Cyprinidae），野鲮亚科（Labeoninae），鲮属（Cirrhina），俗称土鲮、雪鲮、鲮公，是中国南方特有种，是江河捕捞和池塘养殖的主要对象，为两广地区“四大家鱼”——鲢、鳙、草、鲮之一。近年来，鲮鱼出现生长日益退化，小型化加重。这主要是由于长期过度捕捞野生资源，忽视养殖亲鱼选育及种质提纯复壮，水域污染等原因，出现种质退化，遗传力减弱，抗逆性差，性状严重退化等问题，所以此时对鲮进行遗传多样性分析和种群分析能真实的反映出鲮的野生资源状况，掌握其遗传背景资料，为今后珠江鲮的种质资源管理、保护和开发利用提供基础数据。 在本研究中，作者在珠江干流三个不同江段东江惠州段、西江梧州段、北江清远段和来自广东顺德一养殖场的人工繁殖群体进行采样，采用形态学和分子遗传学的方法进行研究，以期掌握珠江鲮不同地理种群与养殖群体的遗传多样性和种群遗传结构资料。 1．珠江鲮不同地理群的形态变异分析 运用传统生物形态学和框架分析方法，对珠江水系中西江、北江和东江鲮的形态变异进行了分析。对渔获物分析发现，西江和北江的鲮资源低龄化、小型化严重应当引起重视，东江资源有所好转，捕获个体也较大。通过对三个江段鲮共30项可量性状数据和框架数据进行方差分析、聚类分析、判别分析和主成分分析，结果显示三个江段的鲮形态有一定程度的分化，北江种群与东江种群的形态相似性较大，两者与西江种群的差异较大，形态变异的大小与地理距离的远近有一定关系，判别分析构建的判别公式可以区分三个江段鲮，判别准确率达到98．2％，主成分分析也可以将三个江段的鲮区分开来。在判别分析和主成分分析中贡献比较大的变量显示三个江段的鲮差异主要表现在头部的某些性状，但从群体间及群体内的形态距离来看，鲮鱼的形态变异不大。在对鲮野生资源进行保护时，建议对地理距离较远的进行分别保护。 2．珠江鲮三个地理种群的微卫星遗传分析 利用部分鲤科鱼类中具多态位点的74对微卫星引物对鲮鱼基因组DNA进行扩增筛选，其中11对引物可稳定扩增且有较高的多态性，占总引物数的14．86％，并利用筛选的引物对鲮鱼惠州群体（东江群体E）、梧州群体（西江群体W）、清远群体（北江群体N）进行遗传多样性分析。结果显示：11对引物扩增得到等位基因数为4～18个，大小为100～374bp，平均多态信息含量为0．7588，不同群体的观测杂合度为0．5105～0．5714，期望杂合度为0．7081～0．7708，W群体为0．7081±0．3712，E群体为0．7708±0．4006，N群体为0．7359±0．3841，不同群体遗传多样性基本一致，杂合度水平相差不大。运用Genetix软件计算得到三个群体间的基因分化系数为0．0499～0．0721。AMOVA分析表明群体间的变异占总变异的9．86％，群体内个体间的变异占90．14％，固定系数为0．0986，群体间具有一定程度的分化，但分化主要表现在西江群体与东江群体和北江群体之间，东江群体与北江群体间的分化不明显。 3．西江野生鲮与养殖群体的遗传分析利用部分鲤科鱼类中具多态位点的74对微卫星引物对鲮基因组DNA进行扩增筛选，其中11对引物可稳定扩增且有较高的多态性，占总引物数的14．86％，并利用筛选的引物对西江段3个野生鲮群体（深色群体G、浅色群体Y、西江群体W）和1个人工养殖群体C进行遗传多样性分析。结果显示：11个引物扩增得到等位基因数为4～23个，大小为100～374bp，平均多态信息含量为0．7498，不同群体的观测杂合度为0．5105～0．6273，期望杂合度为0．7120～0．7656，G、Y、W、C群体的Nei氏基因多样度分别为0．7451±0．3884，0．7632±0．3968，0．7081±0．3712，0．7392±0．3852，野生群体与养殖群体相比，杂合度和遗传多样性水平基本一致。运用Genetix软件计算得到4个群体间的基因分化系数为0．0268～0．0703。AMOVA分析表明群体间的变异占总变异的6．96％，群体内个体间的变异占93．04％，固定系数为0．06964，群体间具有一定程度的分化，但分化主要表现在野生和养殖群体之间，而野生群体之间的分化不明显。

目录

文摘

英文文摘

声明

第一章 引言

1.1 我国鲮鱼的养殖现状

1.2 鲮的种质研究

1.3 鱼类遗传多样性的研究概况

1.3.1 生物多样性与遗传多样性

1.3.2 保护物种遗传多样性的意义

1.4 检测物种遗传多样性的方法

1.4.1 形态变异的检测

1.4.2 细胞学标记

1.4.3 蛋白质标记

1.4.4 DNA分子标记

1.5 论文的研究背景、意义、思路和技术路线

1.5.1 研究背景和意义

1.5.2 思路及技术路线

第二章 珠江鲮不同地理群的形态变异分析

2.1 材料与方法

2.1.1 材料

2.1.2 实验方法

2.2 结果

2.2.1 鲮年龄的判定及不同群体的年龄组成

2.2.2 鲮的可量性状和框架分析

2.3 讨论

第三章 珠汀鲮三个地理种群的微卫星遗传分析

3.1 材料与方法

3.1.1 材料

3.1.2 引物与试剂

3.1.3 方法

3.2 结果

3.2.1 PCR扩增结果

3.2.2 珠江野生鲮鱼的遗传多样性

3.2.3 鲮鱼群体遗传分化

3.3 讨论

3.3.1 微卫星引物的适用性

3.3.2 鲮鱼群体内的遗传变异和群体间的遗传分化

第四章 西江野生鲮与养殖群体的遗传分析

4.1 材料与方法

4.1.1 材料

4.1.2 引物与试剂

4.1.3 方法

4.2 结果

4.2.1 PCR扩增结果

4.2.2 西江野生鲮及人工繁殖群体的遗传多样性

4.2.3 鲮群体遗传分化

4.3 讨论

小结

1 珠汀鲮不同地理群的形念变异分析

2 珠江鲮三个地理种群的微卫星遗传分析

3 西江野生鲮与养殖群体的遗传分析

参考文献

附录 珠江鲮图片

攻读硕士期间论文发表情况

致谢