哲罗鱼生长性状的SSR分析及利用AFLP技术筛选与哲罗鱼性别相关的分子标记

摘要

哲罗鱼是我国的濒危物种，是一种大型冷水性鱼类，同时也是一种优良的淡水养殖种类。本研究利用分子标记技术研究了哲罗鱼生长性状及性别方面，主要包括以下内容：使用筛选出的多态性较好的22个微卫星分子标记分析了183尾人工养殖哲罗鱼（四个家系）的遗传多样性，共检测到67个等位基因，等位基因片段大小为109-452bp，平均观测等位基因数为3.0455，有效等位基因数为2.6522，平均观测杂合度和期望杂合度分别为0.5835和0.5640，22个位点中，有10个属于高度多态位点，11个属于中度多态位点，1个属于低度多态位点。
　　 基于22个微卫星标记在4个家系的183尾哲罗鱼中扩增出的图谱，确定每个个体的基因型，利用CERVUS3.0软件进行亲权分析，计算候选父母的似然估计LOD值，LOD值最大者认为是真实父母，将4个家系区分开。在4对候选父母对的情况下，鉴定出了176尾哲罗鱼子代，混养群体的家系鉴定率为96.17％。实验测量了183尾哲罗鱼的体重、全长、体长、叉长、体高、体宽、头长、头高、头宽、吻长、口裂长、口裂宽、眼径、眼间距等14种生长性状，利用SPSS11.5软件进行生长性状与分子标记的相关性分析，获得12个与至少一种性状显著相关的标记，对这12个标记进行基因型间的多重比较，结果有17种基因型与至少一种性状呈正相关，12种基因型与至少一种性状呈负相关，这就为今后哲罗鱼的遗传育种工作提供了有效的分子标记。利用扩增片段长度多态性技术，分析比较了雌雄哲罗鱼之间的遗传差异。采用EcoRI/TaqI和EcoRI/Tru9I两个酶切组合，共45对引物组合对雌雄个体进行扩增，结果表明，电泳检测条带清晰丰富，两个酶切组合分别扩增出958和971个位点，多态性比例分别在4.76％～62.26％和6.98％～37.50％，研究结果未发现雌雄特异位点，但有15个位点在雌雄个体中的比例存在很大差异，使用这15个位点进行的聚类分析结果显示雌鱼聚在一起，雄鱼聚在一起。本研究积累了大量AFLP分析数据，可为哲罗鱼性别的进一步研究奠定基础。

目录

文摘

英文文摘

上海海洋大学硕士学位论文答辩委员会成员名单

引言

1．分子标记概述

1.1 SSR分子标记

1.2 AFLP分子标记

2．哲罗鱼的研究现状

3．论文研究背景、研究目的和意义

第一章 与哲罗鱼生长相关分子标记的研究

1．材料与方法

1.1 实验材料

1.2 主要试剂

1.3 主要仪器

1.4 方法

1.5 数据处理

2．结果与分析

2.1 微卫星引物在哲罗鱼野生群体遗传多样性分析中的应用

2.2 子代遗传多样性分析

2.3 子代家系的鉴别

2.4 微卫星标记与生长性状的相关分析

3.讨论

3.1 微卫星标记的开发及其在哲罗鱼遗传多样性分析中的应用

3.2 家系鉴定

3.3 微卫星标记与生长性状的关联分析

第二章 与哲罗鱼性别相关的AFLP分子标记的研究

1．材料与方法

1.1 实验材料

1.2 主要试剂

1.3 主要仪器

1.4 方法

1.5 数据处理

2．结果与分析

2.1 DNA浓度及纯度的检测

2.2 AFLP技术体系优化结果

2.3 AFLP扩增结果

3．讨论

结论

参考文献

攻读硕士期间发表论文：

致谢