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摘 要
1 长牡蛎生物学概述
1.1 分类地位
1.2 形态构造
1.3 雌雄同体现象及自交和近交
1.4 摄食习性
1.5 糖原含量相关研究
2 长牡蛎遗传育种研究进展
2.1 选择育种
2.2 杂交育种
2.3 多倍体育种
2.4 分子育种
3 简单重复序列标记
4 表观遗传学及DNA甲基化
4.1 表观遗传学概述
4.2 DNA甲基化技术
4.2.1 DNA甲基化的概念与特点
4.2.2 DNA甲基化的功能
4.3 DNA甲基化研究方法
4.4 DNA甲基化在水产动物中的研究进展
5 本研究的目的和意义
1 实验材料的获取
1.1 亲本的暂养与促熟
1.2 人工授精和孵化
1.3 选优与幼虫培育
1.4稚贝附着与暂养
1.5海上养成
1.6 取样
2 实验方法
2.1 DNA的提取及浓度测定
2.1.1试剂的准备
2.1.2仪器的准备
2.1.3 操作步骤
2.1.4 DNA浓度的测定
2.2 PCR扩增
2.2.1 引物信息
2.2.2 扩增体系及反应程序
2.3 产物检测
2.3.1 1%琼脂糖凝胶电泳检测
2.3.2 聚丙烯酰胺凝胶电泳
2.4 数据统计分析
3 结果
3.1 PCR检测结果
3.2 4个长牡蛎实验组的微卫星遗传多样性
3.3 四个实验组遗传结构分析
3.4 各生长性状指标
4 讨论
4.1 遗传多样性和遗传结构
4.2 生长性状
1 实验材料的获取
1.1 亲本的暂养与促熟
1.2 人工授精和孵化
1.3选优与幼虫培育
1.4稚贝附着与暂养
1.5海上养成
1.6取样
1.7样品处理
2实验方法
2.1 糖原含量测定
2.2 DNA的提取及浓度测定
2.3 MethyRAD 建库及测序
3 数据处理
3.1数据基本处理
3.2甲基化位点在全基因组上的分布
3.3 甲基化测序深度及在基因组不同功能元件上的分布
3.4位点甲基化水平的相对定量
3.5样品间甲基化水平比较
3.6 组间甲基化水平比较
4 结果分析
4.1 牡蛎糖原含量检测结果及差异性检验
4.2 牡蛎基因组检测结果
4.3 甲基化位点在全基因组上的分布和甲基化位点测序深度
4.4 甲基化位点在基因组不同功能元件上的分布
4.5 甲基化位点在基因区的分布
4.6 样品间甲基化水平比较
4.7 组间甲基化水平比较
4.7.1全基因组DNA甲基化差异分析
4.7.2 甲基化水平差异位点在不同基因功能元件上的分布
4.7.3 甲基化水平差异位点的GO富集分析
4.7.4 甲基化水平差异位点的KEGG分析
5 讨论
5.1长牡蛎主要的甲基化模式
5.2 4个家系共有差异甲基化基因分析
5.3 与长牡蛎糖原含量相关的基因、GO、KEGG分析
5.4 牡蛎性腺甲基化遗传与环境分析
5.5 长牡蛎糖原含量甲基化调控机制
