基因芯片关键技术探讨及在肿瘤表达谱中的应用研究

摘要

基因芯片技术是一种被用来平行分析大量基因的序列和功能信息的强有力的工具.目前在各种类型的基因芯片里,应该最广泛的是cDNA芯片,主要用途是表达谱分析.杂交动力学和实验结果的可重复性是基因芯片表达谱研究中的十分重要的研究内容.该文以单基因芯片对DNA芯片的杂交动力学进行了初步的研究.我们将不同浓度的植物cDNA点在玻片上制成DNA芯片,利用体外转录的方法得到植物基因的mRNA,然后通过反转录方法把荧光标记到cDNA上,用不同浓度的荧光标记cDNA对芯片进行杂交,根据结果分析了靶序列和探针浓度变化对芯片杂交信号产生的影响,并利用多基因模拟芯片分析了不同基因的杂交动力学特点.此外,该文还利用12800点的高密度芯片进行了2组不同的表达谱实验,对芯片结果的可重复性做了验证.该文对cDNA芯片关键技术进行了探讨并对关键步骤进行了优化,同时对cDNA芯片在肿瘤研究中的应用进行了初步研究.该文所制备的cDNA芯片和建立的实验体系准确、有效,能够成功应用在表达谱分析研究中.

目录

第一部分前言

1.1引言

1.2基因芯片的类型

1.3基因芯片的制备

1.4基因芯片的应用

1.5基因芯片的发展与展望

1.6本研究要解决的问题

第二部分材料和方法

2.1材料和试剂

2.2实验方法

第三部分实验结果

3.1cDNA芯片实验系统关键技术建立和优化

3.2利用cDNA芯片研究肝癌表达谱实验

第四部分讨论

4.1cDNA芯片实验系统关键技术建立和优化

4.2利用cDNA芯片分析肝癌表达谱

第五部分参考文献

附录

读研期间发表论文情况

致谢

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