精神分裂症/躁郁症易感基因GNB1L的mRNA表达调控

摘要

GNB1L[guanine nucleotide binding protein(G protein), beta polypeptide1-like]和TBX1（T-box1）是位于人染色体22q11.2区的两个相邻基因。该区域可发生1.5M-3M的染色体片段的单倍型缺失，导致22q11.2缺失综合症(22q11.2 deletionsyndrome，22q11.2DS)。许多22q11.2DS的病人具有面部和心脏等发育畸形，同时伴有精神分裂症等精神疾病。由此，该区域的一些基因成为导致精神分裂症的候选基因。白种人和中国汉民族人群的病例-对照实验结果也表明，位于GNB1L基因区域的单核苷酸多态性（SNP）与精神分裂症和躁郁症具有相关性。
　　为了探明GNB1L和TBX1的基因表达调控机制及它们的表达量是否与疾病相关，分别检测了52例人脑前额叶皮层中TBX1和GNB1L mRNA的等位特异性表达差异(AEI)，并使用相对定量qPCR方法测定mRNA表达水平。此外，还使用全基因组芯片对全部样本进行了SNP基因分型。结果表明在GNB1L3'端至少存在一个顺式作用变异（cis-acting variant）调控其rnRNA的表达。对GNB1L3'端区域进行连锁不平衡(LD)分析表明，该顺式作用变异所在的haploblock在先前的病例-对照研究中被证明与精神分裂症和躁郁症相关。但是，通过统计分析没有找到与TBX1表达具有显著相关性的调控变异。结合本研究结果，提出GNB1L的表达量与精神分裂症存/躁郁症存在相关性，并且低表达的等位位点是风险位点。
　　另外，为了进一步分析GNB1L等基因的等位特异性表达的调控机制，建立了可以模拟实验所得log2AEI人群分布型的数学模型。通过使用该模型对已知log2AEI分布型进行模拟，可以初步预测出调控基因表达的顺式作用变异的一些重要特征（如频率、连锁关系等）。这些信息为进一步寻找和定位这些功能性变异提供帮助，也能更有效的选择遗传标签用于病例-对照实验。

目录

摘要

缩略词表

引言

材料与方法

1．人脑组织样本和基因分型

2．cDNA的合成和基因组DNA的提取

3．等位基因表达不平衡(AEI)检测

4．实时定量PCR

5．生物信息学分析

6．酵母双杂交筛选

7．Tag标记蛋白表达载体的构建及IP/Co-IP

结果与讨论

1 寻找调控GNB1L与TBX1 mRNA表达的遗传变异

1．1 结果

1．2 讨论

2 GNB1L蛋白功能的初步研究

2．1 酵母双杂交

2．2 IP/Co-IP

2．3 讨论及对策

3 AEI分布数学模型的建立

3．1 定义

3．2 步骤

3．3 实例

综述

参考文献

致谢

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