上海地区门诊儿童人副流感病毒的流行病学研究

摘要

本文主要从以下几个部分展开论述：
　　第一部分 2009-2010年上海地区人副流感病毒流行病学研究及HPIV-3基因特征分析
　　目的:
　　研究上海地区上呼吸道感染患儿中人副流感病毒（Human Parainfluenzaviruse，HPIVs）的流行病学规律，以及人3型副流感病毒(HPIV-3)的基因特征，为中国大陆地区人副流感病毒的分子流行病学研究积累数据。
　　方法:
　　1.收集2009年6月7日至2010年6月5日在上海交通大学附属新华医院发热门诊就诊的有发热、咳嗽、流涕和咽痛等散发上呼吸道感染症状的患儿咽拭子标本164例。
　　2.采用多重RT-PCR方法检测其包括HPIV1-4在内的多种常见呼吸道病原，并对HPIVs在婴幼儿呼吸道感染中所占的比例、性别、年龄和季节分布进行分析。
　　3.选择检测出的HPIV-3阳性样本，用两对引物扩增出HPIV-3 HN基因的全长并测序，根据序列测定结果进行核苷酸和氨基酸的同源性分析，应用比邻法（Neighbor-Joining Tree）建立HPIV-3 HN基因的系统进化树。
　　结果:
　　1.164例患儿咽拭子标本均用Seeplex RV15 ACE方法检测，共检测出病毒感染阳性病例129例，总检出率达78.7％，其中HPIVs检测总阳性率为42.7％(70/164)，是检出率最高的呼吸道病毒。70例HPIVs阳性标本中，HPIV-1检出14例，阳性率为8.5％(14/164); HPIV-2检出30例，阳性率为18.3％(30/164);HPIV-3检出23例，阳性率为14.0％(23/164); HPIV-4检出3例，阳性率为1.8％(3/164)。
　　2.70例HPIVs阳性标本中，45.7％(32/70)存在混合感染。HPIVs感染在12-24月组患儿检出人数最多为74.1％(40/54)，在0-12月组检出人数最低为9.7％(6/62)，HPIVs在各年龄组间检出率差异具有统计学意义（x2=50.408，P=0.000）。HPlVs感染患儿男女间检出率差异无统计学意义(x2=1.844，P=0.204)。
　　3.本地区HPIVs感染具有明显的季节性分布，春季(76.5％)和夏季(47.2％)的检出率高于秋季(32.3％)和冬季(22.2％)，四个季节总检出率差异具有统计学意义(x2=14.594，P=0.002)。
　　4.基因同源性分析表明，5株HPIV-3上海株之间核苷酸和氨基酸的同源性分别为99.0-99.5％和99.7-100％，与11株国内代表株系的HPIV-3之间核苷酸和氨基酸的同源性分别为97.1-99.8％和99.0-100％;与日本（除去GP株）、印度和沙特阿拉伯这三个亚洲国家的HPIV-3之间核苷酸和氨基酸的同源性分别为96.0-98.7％和97.0-99.5％;与美国（除去俄克拉何马州）、加拿大和澳大利亚的HPIV-3之间核苷酸和氨基酸的同源性分别为94.4-95.4％和96.7-97.7％，同源性最低。
　　5.系统进化树把5株HPIV-3上海株和36株代表株系共41株分为了A、B、C三个进化群，C群又进一步分为4个亚群C1-C4。C群主要由2002-2011年期间在亚洲国家发现的HPIV-3构成，传播范围较广，涉及日本、印度、沙特阿拉伯和中国，可能是现今亚洲地区HPIV-3流行的主要基因型。5株上海株和中国北京2008-2009年间的多个HPIV-3分离株都属于C3a株系，其中ShangHai.210与BJ001/08、ShangHai.1261与BJ001/08、ShangHai.1431与BJ005/08、ShangHai.1431与BJ270/09之间核苷酸的同源性分别为99.6％、99.4％、99.4％和99.1％，但是其氨基酸的同源性都为100％。
　　结论:
　　1.HPIVs在上海地区婴幼儿呼吸道感染中占有重要地位，42.7％的患儿HPIVs检测阳性，其中HPIV-2感染人数最多，HPIV-1和HPIV-3次之。
　　2.HPIVs感染有明显的年龄分布特征，而无性别分布差异，在12-24月年龄组患儿检出人数最多。HPIVs感染也具有明显的季节性分布，流行高峰在春夏季。
　　3.系统进化树把41株HPIV-3株系分为了A、B、C三个进化群，C群是现今亚洲地区流行的主要基因型。5株上海株和中国北京2008-2009年间的多个HPIV-3分离株都属于C3a株系，提示上海株可能是由北京株C3a亚群衍化而来。5株上海株与亚洲国家的多个HPIV-3株系均在同一亚群内，同源性也比较高，提示不同HPIV-3分离株之间的进化很可能具有地域相关性。
　　第二部分 1996-2013年中国人群中副流感病毒感染流行病学的Meta分析
　　目的:
　　综合分析中国人群副流感病毒感染的流行状况，为PIVs感染的诊断和相关疾病的防治提供数据基础和科学根据。
　　方法:
　　在Pubmed、中国期刊全文数据库CNKI、维普中文科技期刊全文数据库、万方数据库中检索所有有关副流感病毒流行情况的文献，按照纳入及排除标准筛选出质量合格的文献，整理并制作成数据库进行Meta分析。
　　结果:
　　初选获得493篇文献，最终纳入文献52篇，总样本量为186，053例。我国急性呼吸道感染(ARI)患者中副流感病毒(PIVs)的综合感染率为6.8％;0-3岁组（≤1岁组7.7％和1-3岁组8.9％）PIVs综合感染率高于＞3岁组(6.8％)，PIVs综合感染率在男女性别间差异无显著性;不同季节ARI患者PIVs的综合感染率分别为春季8.2％、夏季8.0％、秋季6.6％和冬季5.1％;上、下呼吸道感染中PIVs的综合感染率分别为7.2％和8.9％，PIVs感染较易引起支气管炎(9.3％)、肺炎(8.2％)和支气管肺炎(8.7％)，毛细支气管炎的综合感染率稍低(7.1％)。
　　结论:
　　不同地区ARI患者PIVs的感染率各不相同;PIVs感染与患儿年龄呈负相关，与男女性别无关;PIVs的综合感染率春夏季偏高;PIVs感染以急性下呼吸道感染为主，主要为支气管炎、肺炎和支气管肺炎等。

目录

常用缩略语

摘要

前言

第一部分：2009-2010年上海地区人副流感病毒流行病学研究及HPIV-3基因特征分析

材料和方法

1．研究对象

2．标本采集

3．实验材料和仪器

4．实验方法

5．统计学方法

结果

1．多重PCR产物的电泳结果

2．临床标本多重RT-PCR检测结果

3．HPIVs与其他病毒的混合感染情况

4．HPIVs感染的性别分布

5．HPIVs感染的年龄分布

6．HPIVs感染的季节分布

7．HPIV-3基因特征分析

讨论

结论

第二部分：1996-2013年中国人群中副流感病毒感染流行病学的Meta分析

资料和方法

1．文献检索和资料来源

2．文献筛选

3．资料提取和质量评价

4．数据统计和分析

结果

1．文献检索结果

2．调查人群人口学特征

3．不同地区PIVs的流行情况

4．PIVs在不同患者人群中的分布

5．PIVs在不同地区不同季节的流行情况

6．PIVs在不同临床疾病中的流行情况

讨论

结论

参考文献

综述 人副流感病毒的研究进展

攻读学位期间撰写及发表的论文

致谢

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