第一个书签之前
目 录
摘 要
Abstract
缩略词表
前 言
第一部分 人喉癌组织样本GC-TOFMS代谢组学检测
一、实验材料与方法
(一)实验材料
(二)实验仪器及试剂
(三)实验方法
(四)预实验
(五)预实验结果
(六)预实验结果评价
(七)正式实验
第二部分 人喉癌组织样本GC-TOFMS代谢组学数据分析
一、样本材料信息
二、数据分析方法内容
三、数据分析流程
四、数据分析结果
(一)原始数据处理
(二)主成分(PCA)分析
(三)偏最小二乘法-判别分析(PLS-DA)及对模型的验证
(四)正交偏最小二乘法-判别分析(OPLS-DA)
(五)差异代谢物的筛选与鉴定
(六)差异代谢物的层次聚类分析
(七)代谢通路KEGG分析
(八)喉癌组织中代谢特点分析
(九)差异代谢物ROC曲线分析
第三部分 代谢组学结合蛋白质组学筛选喉癌肿瘤标志物及其对喉癌发生作用机制的探讨
一、实验方法材料
(一)蛋白组学数据来源
(二)差异蛋白及代谢物的KEGG注释
二、数据分析结果
(一)经KEGG数据库分析得出6个密切相关代谢通路图
(二)经关联 KEGG分析获得与差异蛋白质关联的差异代谢物
(三)经关联分析筛选的差异代谢物进行Bi plot分析结果
(四)经关联代谢通路图在 KEGG中找出7个与差异性代谢产物相关联的差异蛋白质
(五)关联分析筛选蛋白GO分析结果
(六)差异蛋白质与差异代谢物简化关联图
第四部分 差异蛋白CNDP2对喉癌细胞增殖迁移能力的影响
一、材料与方法
(一) 实验材料
(二)实验方法
二、结果
(一)组织芯片检测喉癌样本中CNDP2的表达
(二)CNDP2三株喉癌细胞系中的表达
(三)CNDP2在FaDu和LSC-1细胞系中完全敲除
(四)CNDP2对喉癌细胞系FaDu和LSC-1生长和存活的影响
(五)CNDP2对喉癌细胞系迁移能力的影响
讨 论
一、代谢组学技术在喉癌标志物筛选中的应用
二、代谢组学结合蛋白组学研究分析喉癌发生发展的机制探讨
三、关联差异蛋白CNDP2对喉癌细胞增殖迁移的影响
四、代谢组学结合蛋白质组学从整体水平探索喉癌发生机制
结 论
存在问题与展望
参考文献
文献综述
一、代谢组学概念
二、肿瘤代谢组学研究方法及流程
(一)核磁共振技术
(二)质谱联用技术
(三)代谢组学的研究流程
三、代谢组学在肿瘤标志物的筛选中的应用
四、代谢组学在肿瘤早期诊断中的应用
五、代谢组学在恶性肿瘤诊断与鉴别诊断中的应用
六、代谢组学在抗癌个性化治疗以及疗效与预后评估中的应用
七、代谢组学联合其他组学从整体水平探索恶性肿瘤发病机制
在读期间发表论文及参与科研情况
致 谢