乳铁蛋白基因多态性与奶牛乳房炎的相关性研究

摘要

本文对乳铁蛋白基因多态性与奶牛乳房炎的相关性进行了研究。文章采用PCR-SSCP技术，以中国荷斯坦牛群体共计133头个体为研究对象，分析了乳铁蛋白基因的多态性，运用最小二乘线性模型，对所检测到的多态位点与奶牛乳房炎的相关性进行了分析，并结合测序技术对这几个多态位点进行了序列分析。结果表明，在样本群体中BLF-5'的AA基因型的SCS<,LAW>最大，BB基因型的SCS<,LAW>最小。两者的差异极显著(P<0.01)。同时BLF5'基因座位无论是在感染牛还是健康牛中，都是AA基因型分布频率最高。说明BLF5'-BB可能和乳房炎的抗性有关，BLF5'-AA可能和奶牛乳房炎的易感性有关。

目录

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声明

第一章文献综述

1.1奶牛乳房炎研究进展

1.1.1奶牛乳房炎的研究现状

1.1.2奶牛乳房炎的发生

1.1.3乳房炎的诊断

1.1.4乳房炎的防治

1.1.5乳房炎对乳蛋白含量的影响

1.1.6乳房炎的遗传学研究

1.1.7抗乳房炎性状候选基因的研究

1.2乳铁蛋白的结构和特性

1.2.1乳铁蛋白的分子结构

1.2.2乳铁蛋白的属性

1.2.3乳铁蛋白在体内的分布、含量及代谢

1.2.4乳铁蛋白的主要生物学作用

1.2.5乳铁蛋白受体

1.2.6乳铁蛋白基因

1.3乳铁蛋白和乳房炎的关系

1.4本研究的目的意义

第二章材料与方法

2.1实验材料

2.2主要仪器设备及试剂、溶液的配制

2.2.1主要仪器设备

2.2.2主要试剂

2.2.3主要药品及试剂的配制

2.3实验方法

2.3.1实验牛血液DNA的提取和检测

2.3.2 BLF基因的PCR扩增

2.3.3 BLF基因的SSCP分析

2.4统计分析

2.4.1基因频率和基因型频率的计算

2.4.2基因频率和基因型频率的差异显著性检验

2.4.3多态信息含量(polymorphism information content,PIC):

2.4.4群体杂合度

2.4.5有效等位基因数

2.4.6 Hardy-Weinberg平衡检测

2.4.7 SCC的转换与校正

2.4.8统计分析模型

第三章结果与分析

3.1基因组DNA检测

3.2 BLF基因5'侧翼区的PCR-SSCP标记

3.2.1 BLF基因引物BLFP1扩增产物的PCR-SSCP标记

3.3 BLF基因第5外显子的PCR-SSCP标记

3.3.1 BLF基因引物BLFP2扩增产物的PCR-SSCP标记

3.4 BLF基因第15外显子的PCR-SSCP标记

3.4.1 BLF基因引物BLFP3扩增产物的PCR-SSCP标记

3.5 BLF基因第8内含子的PCR-SSCP标记

3.5.1 BLF基因引物BLFP4扩增产物的PCR-SSCP标记

3.6 BLF基因第13内含子的PCR-SSCP标记

3.6.1 BLF基因引物BLFP5扩增产物的PCR-SSCP标记

3.7 BLF基因第11内含子的PCR-SSCP标记

3.7.1 BLF基因引物BLFP6扩增产物的PCR-SSCP标记

3.8 BLF基因第10内含子的PCR-SSCP标记

3.8.1 BLF基因引物BLFP7扩增产物的PCR-SSCP标记

3.9 BLF基因第11外显子的PCR-SSCP标记

3.9.1 BLF基因引物BLFP8扩增产物的PCR-SSCP标记

3.10 BLF基因第16外显子的PCR-SSCP标记

3.10.1 BLF基因引物BLFP9扩增产物的PCR-SSCP标记

3.11BLF基因第14内含子的PCR-SSCP标记

3.11.1 BLF基因引物BLFP10扩增产物的PCR-SSCP标记

第四章讨论和结论

4.1样品的采集、保存以及DNA的提取

4.2 PCR反应体系与反应条件的优化

4.3 PCR-SSCP技术影响因素分析

4.4 BLF基因多态性与奶牛乳房炎关联分析

4.4.1 BLF 5'-region位点多态性与奶牛乳房炎的相关性分析

4.4.2 BLF intron 8位点多态性与奶牛乳房炎的相关性分析

4.5测序结果分析

4.6利用GLM对奶牛乳房炎的影响因素进行分析

4.6.1胎次、场、泌乳月对奶牛乳房炎的影响

4.6.2年龄对奶牛乳房炎的影响

4.7结论

4.7.1 BLF 5'-region位点多态性与奶牛乳房炎的相关性

4.7.2 BLF intron 8位点多态性与奶牛乳房炎的相关性

4.7.3影响奶牛乳房炎的因素

参考文献

附录

致谢

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