大肠癌组织、腺瘤组织和正常黏膜组织的基因表达谱分析

摘要

目的：本研究的主要目的是通过建立具有组织特异性的大肠癌基因表达谱，从转录组整体水平寻找大肠肿瘤组织、腺瘤组织与正常组织之间的基因表达模式差异，发现用于预防和早期检测的候选分子标志物以及基因治疗的可能靶点。 方法：利用包含47，000个转录本及变异体的AffymetrixU133plus2.0全基因组芯片筛选大肠癌组织、腺瘤组织与正常组织之间差异表达基因；运用生物信息学手段对差异表达基因进行功能分类，以发现在大肠癌的发生中起重要作用的基因。 结果：1、筛得大肠癌相关基因和ESTs2340个(占基因和ESTs总数的4.28％)，其中：大肠癌组表达上调者609个(占基因和ESTs总数的1.12％)；大肠癌组表达下调者1731个(占基因和ESTs总数的3.16％) 2、筛得早期大肠癌相关基因和ESTs726个(占基因和ESTs总数的1.32％)，其中：大肠癌组与腺瘤组共同表达上调者133个(占基因和ESTs总数的0.24％)；大肠癌组与腺瘤组共同表达下调者593个(占基因和ESTs总数的1.08％) 3、对筛得之大肠癌相关基因和早期大肠癌相关基因进行了功能分类，得到所参与基因的分子功能及生物学过程 大肠癌相关基因所参与的功能类别包括细胞生长和/或维持、对外刺激反应、信号转导、免疫应答、蛋白质代谢、碱基、核苷、核苷酸和核酸代谢等 早期大肠癌相关基因所参与的功能类别包括细胞生长和/或维持、信号转导、蛋白质代谢、对外刺激反应、碱基、核苷、核苷酸和核酸代谢、生物合成等 大肠癌相关基因和早期大肠癌相关基因中，参与细胞生长和/或维持功能的基因占参与分类基因的比例最大，为最大的一组功能基因 4、筛选出5个在腺瘤组织及肿瘤组织中都升高表达8倍以上的基因(CADPS，FABP6，LCN2，CHRM3，CLDN2)，其编码产物为分泌性蛋白或膜表面蛋白，作为早期检测的候选分子标志物以及基因治疗的可能靶点 结论：在大肠癌发生的早期阶段就有多个基因表达的异常开启(活化)或关闭(失活)，通过所编码的蛋白质表达质与量的改变，使细胞的生长调控失常，代谢状态异常、黏附能力下降、对外刺激反应能力降低、信号转导异常等，最终导致了细胞的恶性转化。

目录

文摘

英文文摘

论文说明：英文缩写注释

研究步骤与技术总路线

第一章 大肠癌组织、腺瘤组织和正常组织基因表达谱的检测及验证

第二章 大肠癌相关基因的筛查

第三章 早期大肠癌相关基因的筛查

第四章 基因功能分类

全文讨论

本研究存在的问题及后续计划

参考文献

附表

综述Lipocalin2与肿瘤

致谢