晚期胃癌患者危重病人预警蛋白质(LGT)指纹不同表达时伴随指纹的分析

摘要

目的：分析晚期胃癌患者危重病人预警蛋白质(LGT)指纹不同表达及演变状态下，其伴随指纹的分布特点，构建其指纹库。 方法：研究采用SELDI、CM10蛋白质芯片技术，以晚期胃癌患者血清中出现质核比(M/Z)：11000+H～12000+H的蛋白质指纹，设定为LGT阳性指纹。选取入院接受手术的81例晚期胃癌患者，并进行1年的随访，用SELDI、CM10蛋白质芯片技术对这些患者随访前后各进行一次检测，根据两次检测LGT指纹表达的情况分组，其中，A组：LGT指纹由阴性向阳性演变组(25人)、B组：LGT指纹由阳性向阴性演变组(15人)、C组：LGT指纹持续阴性组(29人)、D组：LGT指纹持续阳性组(12人)。另选自愿抽血的肿瘤患者17例，其中，1组：同一患者一份血样分成两份，间隔一周行SELDI检测(12人)，2组：同一患者连续两天抽血送检(5人)。以此作为SELDI检测系统重复性和稳定性的对照组。采用BiomarkerWizard3.1、BiomarkerPattern软件筛选不同分组胃癌患者的差异指纹，建立相应的决策树模型。 结果： 1．作为对照组，1组共检测了1223个蛋白质组指纹，其中有39个指纹差异有统计学意义(p＜0.05)，M/Z：1058、1085、1086、1094、1008、1122、1011、1007、1030、1004、1005、1015、1017、1026、1028、1031、1033、1042、1055、1056、1057、1066、1068、1069、1070、1072、1073、1123、1141、1144、1167、1029、1055、1098、1099、1100、1101、1102、1103和1109。 2组共检测了468个蛋白质组指纹，其中有18个指纹差异有统计学意义(p＜0.05)，M/Z：753、1056、1058、1085、1008、1030、731、752、1007、1017、1042、1057、1081、1083、1099、1100和1124。差异指纹中M/Z：1007、1008、1017、1030、1042、1056、1057、1058、1085和1099在两种取样状态下均存在，呈双表达。结果认为，两种采样方法出现共同差异蛋白质指纹，说明系统的不稳定性，而其余单表达出现的差异蛋白质说明在采样过程中出现不稳定性。两者都表明，完全重复性是不存在的。 2．作为分析组，A组有6个蛋白质指纹差异有统计学意义(P＜0.05)，与对照组相比无相同指纹，不需剔除。其中上调的指纹M/Z：11473、11821、11664、11409、11552和11947，无下调的指纹。 B组有14个蛋白质指纹差异有统计学意义(P＜0.05)，与对照组比较，M/Z：1098、1029和1007的指纹与之相同，剔除后，剩余了11个有统计学意义的差异蛋白质指纹，其中上调的指纹M/Z：878、861、874、917和3264。下调的指纹M/Z：6523、11509、11669、11413、11351和6483。 C组有1个蛋白质指纹差异有统计学意义(P＜0.05)，对照组中差异指纹M/Z：1029指纹与之相同，予以剔除后，剩余了0个有统计学意义的差异蛋白质指纹。 D组有0个蛋白质指纹差异有统计学意义(P＜0.05)。 结论： 1．对照组中M/Z：1007、1008、1017、1030、1042、1056、1057、1058、1085、1098、1099、731、752、753、1004、1005、1011、1015、1023、1026、1029、1031、1033、1041、1042、1044、1055、1066、1067、1068、1069、1070、1072、1073、1081、1083、1086、1094、1101、1102、1103、1109、1122和1124蛋白质指纹为影响因素，需要予以剔除。 2．SELDI、CM10蛋白质芯片技术检测晚期胃癌患者血清捕获的M/Z：11473、11821、11664、11409、11552和11947蛋白质指纹上调，可视为晚期胃癌患者LGT指纹由阴性向阳性演变时LGT蛋白质指纹亚型；M/Z：11509、11669、11413、11351蛋白质指纹下调可视为胃癌患者LGT指纹由阳性向阴性演变时LGT蛋白质指纹亚型；M/Z：878、861、874、917和3264蛋白质指纹上调，M/Z：6523、和6483蛋白质指纹下调，可视为胃癌忠者LGT指纹由阳性向阴性演变时伴随的相关蛋白质组指纹；而当晚期胃癌患者LGT指纹持续阴性或者持续阳性时无相关的差异蛋白质指纹。

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综述 蛋白质组学在肿瘤中的研究进展

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