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及其调控网络研究
Establishment of microRNA differential expression
Abstract
常用缩写词中英文对照表
前 言
第一部分 中国地鼠口腔黏膜癌中miRNA表达谱的构建和初步分析
1 材料与方法
1.1材料
德国Implen公司
1.2方法
2 结 果
2.1病理鉴定结果
2.2组织中总RNA检测结果
2.3测序原始数据及小RNA序列长度分布
2.4标准信息分析
2.5 miRNA差异表达分析
3 讨 论
4 结 论
第二部分 显著差异miRNA在口腔黏膜癌的RT-qPCR验证
1 材料与方法
1.1材料
德国Implen公司
1.2方法
(4)终止反应:85℃灭活5min,用灭菌水稀释5倍,保存于-20℃冰箱待用。
(2)将Array反应板进行短暂离心后置冰上,往对应的反应孔内加入如下成分至20 μL(正反向引物的
(3)将Array反应板短暂离心,保证反应液均在反应孔底部。
2 结 果
2.1总RNA浓度、纯度及完整性检测
2.2样品组织中miRNA的检测
3 讨 论
4 结 论
第三部分 中国地鼠口腔黏膜癌中显著差异miRNA靶基因预测及生物信息学分析
1 材料与方法
1.1 miRNA表达谱的建立(实验一)
1.2 miRNA聚类分析
1.3 靶基因预测标准
1.4 GO富集分析
1.5 KEGG Pathway分析
2 结 果
2.1 miRNA聚类分析
2.2 miRNA靶基因预测
2.3靶基因GO 富集分析
2.4 KEGG Pathway分析
3 讨 论
4 结 论
第四部分 miR-21通过抑制PTEN/PI3K/AKT信号通路调控口腔黏膜癌变过程中凋亡相关基因的表达
1 材料与方法
1.1 材料
1.1.1组织样本
1.1.2 主要试剂
1.2 方法
1.2.2 免疫组化检测颊囊组织中PTEN、p-AKT、Caspase-3、Caspase-9、Ba
1.2.4 数据统计分析
2 结 果
2.1 miR-21靶基因预测结果
2.2中国地鼠口腔黏膜癌变过程中PTEN和p-AKT蛋白的表达
2.3中国地鼠口腔黏膜癌变过程中相关凋亡蛋白的表达
2.4 RT-qPCR法测定中国地鼠颊囊组织中四种凋亡基因的表达
3 讨 论
4 结 论
参考文献
综述
参考文献
附 录
致 谢
在学期间承担/参与的科研课题与研究成果
个人简历