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中国地鼠口腔黏膜癌中microRNA差异表达谱建立及其调控网络研究

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及其调控网络研究

Establishment of microRNA differential expression

Abstract

常用缩写词中英文对照表

前 言

第一部分 中国地鼠口腔黏膜癌中miRNA表达谱的构建和初步分析

1 材料与方法

1.1材料

德国Implen公司

1.2方法

2 结 果

2.1病理鉴定结果

2.2组织中总RNA检测结果

2.3测序原始数据及小RNA序列长度分布

2.4标准信息分析

2.5 miRNA差异表达分析

3 讨 论

4 结 论

第二部分 显著差异miRNA在口腔黏膜癌的RT-qPCR验证

1 材料与方法

1.1材料

德国Implen公司

1.2方法

(4)终止反应:85℃灭活5min,用灭菌水稀释5倍,保存于-20℃冰箱待用。

(2)将Array反应板进行短暂离心后置冰上,往对应的反应孔内加入如下成分至20 μL(正反向引物的

(3)将Array反应板短暂离心,保证反应液均在反应孔底部。

2 结 果

2.1总RNA浓度、纯度及完整性检测

2.2样品组织中miRNA的检测

3 讨 论

4 结 论

第三部分 中国地鼠口腔黏膜癌中显著差异miRNA靶基因预测及生物信息学分析

1 材料与方法

1.1 miRNA表达谱的建立(实验一)

1.2 miRNA聚类分析

1.3 靶基因预测标准

1.4 GO富集分析

1.5 KEGG Pathway分析

2 结 果

2.1 miRNA聚类分析

2.2 miRNA靶基因预测

2.3靶基因GO 富集分析

2.4 KEGG Pathway分析

3 讨 论

4 结 论

第四部分 miR-21通过抑制PTEN/PI3K/AKT信号通路调控口腔黏膜癌变过程中凋亡相关基因的表达

1 材料与方法

1.1 材料

1.1.1组织样本

1.1.2 主要试剂

1.2 方法

1.2.2 免疫组化检测颊囊组织中PTEN、p-AKT、Caspase-3、Caspase-9、Ba

1.2.4 数据统计分析

2 结 果

2.1 miR-21靶基因预测结果

2.2中国地鼠口腔黏膜癌变过程中PTEN和p-AKT蛋白的表达

2.3中国地鼠口腔黏膜癌变过程中相关凋亡蛋白的表达

2.4 RT-qPCR法测定中国地鼠颊囊组织中四种凋亡基因的表达

3 讨 论

4 结 论

参考文献

综述

参考文献

附 录

致 谢

在学期间承担/参与的科研课题与研究成果

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