声明
第一章 绪论
1.1课题的背景和意义
1.2国内外研究现状
1.2.1 GWAS发展现状
1.2.2 选择标签SNP的相关方法
1.3课题主要研究内容
1.4论文的组织结构
第二章 标签SNP 选择的生物学依据
2.1 SNP 概念简要介绍
2.2连锁与连锁不平衡
2.2.1 连锁、重组和连锁分析
2.2.2 连锁不平衡与关联分析
2.3单体域的定义与构建
2.4 本章小结
第三章 实验方法、数据及开发环境
3.1符号说明
3.2最大信息SNP集选择算法
3.3序列核关联检验（Sequence kernel association test, SKAT）
3.4仿真数据来源
3.5仿真数据实现
3.5.1 对照组数据仿真方法
3.5.2 实验组数据仿真方法
3.5.3 仿真数据的形成算法
3.5.4 HAPGEN2 软件的使用方法
3.5.5 本文仿真数据细节
3.5.6 数据处理
3.6阈值t1选择
3.7 开发环境介绍
3.7.1 R语言介绍
3.7.2 R语言特点
3.8 本章小结
第四章 实验结果及分析
4.2 Ⅰ类错误率估计
4.3功效估计
4.4时间复杂度估计
4.5基因分型成本估计
4.6结果分析和讨论
4.7 本章小结
总结与展望
参考文献
攻读硕士学位期间取得的学术成果
致谢
