我国东黄海鳀鱼自然群体的遗传多样性研究

摘要

该研究采用RAPD技术和DNA序列分析,从核DNA和线粒体DNA(核外基因)两个角度对中国东黄海海域鳀鱼的3个自然群体的遗传结构和遗传变异水平进行了研究,从基因水平揭示了中国东黄海海域鳀鱼的遗传多样性背景.另外,通过生物信息学的方法,初步分析了鲱形目鱼类莎瑙鱼属、黍鲱属、鲱属、小沙丁鱼属、沙丁鱼属、鳀属等6个属,15种的cytb基因片段的分子进化系统.结果表明,鲱形目鱼类这6个属15种的cytb基因片段的分子系统树与传统分类学基本相一致.

目录

摘要

Abstract

第一章文献综述

1生物多样性研究进展

1.1含义及其研究对象

1.2研究进展与发展趋势

1.3保护生物多样性的价值和意义

2遗传多样性的研究方法

2.1形态标记

2.2细胞标记

2.3生化标记

2.4分子标记

3分子标记在鱼类遗传多样性研究中的应用

4结语

第二章我国东黄海鳀鱼遗传多样性的RAPD分析

1材料和方法

1.1样本采集

1.2基因组DNA的提取

1.3反应条件的筛选与建立

1.4 PCR扩增

1.5筛选引物

1.6数据处理

1.7 RAPD数据的统计参数

2实验结果与分析

2.1基因组DNA提取结果

2.2反应条件筛选与建立的结果

2.3引物筛选结果

2.4 RAPD扩增的结果与分析

3结论

第三章我国东黄海鳀鱼线粒体DNAcytb基因的遗传多样性分析

1实验材料与方法

1.1实验材料

1.2基因组DNA的提取。与第二章相同

1.3目的DNA片段的PCR扩增

1.4 PCR产物纯化

1.5测序

1.6 DNA序列数据的处理

2实验结果与分析

2.1目的DNA片段的PCR的扩增

2.2鳀鱼cytb基因片段的基本统计与分析

2.3不同群体的遗传多样性分析

2.4群体间的遗传多样性分析

2.5遗传距离与系统树

3结论

第四章生物信息学方法在鲱形目系统进化中的应用

1生物信息学方法简介

1.1产生背景

1.2概念

1.3内容

1.4应用

2生物信息学方法在鲱形目系统进化分析中的应用

2.1鲱形目鱼类mtDNAcytb基因序列来源

2.2鲱形目鱼类mtDNAcytb基因序列的比较分析

3结论

参考文献

附录

致谢