rDNA序列在几种浮游植物的分类和中肋骨条藻定量检测中的应用

摘要

该论文首先对分离自胶州湾的十一种浮游植物的rDNA序列进行了PCR扩增、克隆、序列测定、序列相似性分析,并利用测得的小亚基(SSU)rDNA序列分析了这些浮游植物的系统进化关系.结果发现三株角毛藻的rDNA序列相似性非常高(全序列的相似性均大于99﹪),进化距离也非常接近;而两株裸甲藻(一株裸甲藻未鉴定种(Gymnodinium sp.,编号为GYN-15)、一株米氏裸甲藻(Gymnodinium mikimotoi)虽然进化距离接近,但它们的rDNA序列相似性却很低,全长序列的相似性仅为54.1﹪.通过上述这些研究,该论文发现裸甲藻未鉴定种与共生甲藻属(Symbiodinium)的两个种具有很近的亲缘关系和进化距离,初步将该藻鉴定为属于共生甲藻属;命名了共生甲藻属中一个新的子类群——Clade F;首次发现了不同种角毛藻之间具有很近的亲缘关系;初步建立了定量检测中肋骨条藻的新方法——RFQ-PCR.

目录

文献综述

一.海洋浮游植物及其生态意义

二.海洋浮游植物种群结构及其动态变化的监测

三.核糖体DNA序列在海洋浮游植物分类和定量检测中的应用

四.小结与展望

参考文献

第一章：几种浮游植物的rDNA序列及系统进化关系分析

0.前言

1.主要材料

2.方法

3.结果

4.小结与讨论

5.附录(图表)

参考文献

第二章：中肋骨条藻定量检测方法(实时荧光定量PCR)的初步建立

0.前言

1.主要材料

2.方法

3.结果

4.小结与讨论

5.附录(图表)

6.参考文献

第三章：利用rDNA序列对一株裸甲藻属未鉴定种的初步鉴定

0.前言

1.方法

2.结果

3.小结与讨论

4.附录(图表)

参考文献

第四章：三种角毛藻亲缘关系和遗传差异的研究

0.前言

1.方法

2.结果

3.小结与讨论

4.附录(图表)

参考文献

第五章：总结和展望

附：博士期间拟发表的文章及申请的专利：

致谢