暗色丝孢真菌细基格孢属（Ulocladium）、匍柄霉属（Stemphylium）及链格孢属（Alternaria）的分类和分子系统学研究

摘要

本研究利用PAUP*软件中的简约法(parsimony method)和邻近结合距离法(neighbor-joining method)对植物致病性真菌细基格孢属(Ulocladium)、匍柄霉属(Stemphylium)及链格孢属(Alternaria)的典型菌种进行了分子系统发育分析，探索出一套基于基因序列同源性比较分析的分子系统学研究方法，修订了该类群真菌现代分类系统并分析其属内种间和相似属间遗传演化的关系。同时将形态分类和分子系统学技术相结合应用于该类群真菌的进一步分类研究上，分离并定义新菌种。

目录

关于学位论文原创性和使用授权的声明

英文缩写符号及中英文对照表

1引言

1.1分子系统学研究的基本原理

1.1.1分子系统学发展和应用

1.1.2分子系统学基本原理与方法

1.1.3分子系统学在现代真菌分类中的应用

1.2植物致病性暗色丝孢真菌的分类研究状况

1.2.1经济重要性

1.2.2细基格孢属(Ulocladium)、匍柄霉属(Stemphylium)及链格孢属(Alternaria)的分类标准

1.2.3三个属的分类研究中存在的问题

1.3本研究的目的和意义

2材料与方法

2.1实验材料与仪器

2.1.1菌种及标本来源

2.1.2培养基

2.1.3仪器与试剂

2.2形态分类实验方法

2.2.1标本处理

2.2.2纯培养的获得

2.2.3描述鉴定

2.3分子系统学研究方法

2.3.1受试菌株

2.3.2菌体培养

2.3.3 DNA的提取

2.3.4 PCR引物设计、反应体系及步骤

2.3.5 ITS扩增产物测序

2.3.6 gpd扩增产物测序

2.3.7数据处理方法

3结果与分析

3.1新种的描述

3.1.1亚小球匍柄霉Stemphylium subglobuliferum（文章已接收）

3.1.2辣椒细基格孢Ulocladium capsicum（待发表）

3.2新种的分子系统学证据

3.2.1采用简约法对亚小球匍柄霉(Stemphylium subglobuliferum)的分子系统学分析结果

3.2.2采用距离法对辣椒细基格孢(Ulocladium capsicum)的分子系统学分析结果

3.3三属的分类和分子系统学关系

4讨论与结论

4.1形态分类条件的优化

4.2基于基因测序的分子系统学研究方法的优越性

4.3分子系统学研究中应注意的外群选择问题

4.4细基格孢属(Ulocladium)分类标准的修订

4.5链格孢属(Alternaria)分类标准的修订

参考文献

致谢

攻读学位期间发表论文情况

gpd基因片断酶切（patⅠ）鉴定图