核桃(Juglans regia)SRAP遗传连锁图谱的构建和QTL定位

摘要

核桃是重要的林、果兼用经济林树种。核桃的果实性状和生长性状是受多基因控制的典型数量性状，易受环境影响，利用DNA标记构建核桃分子遗传图谱，定位主要经济性状的QTL位点，是开展核桃分子设计育种的基础环节。本研究以（元林×青林）110个单株构建的F1群体为作图群体，利用SRAP标记构建核桃的遗传连锁图谱，对树高、萌芽力、干果纵径、干果横径、干果重等性状进行了QTL定位分析。主要结果如下：
　　 1.以母本‘元林’和父本‘青林’的DNA为模板，对100对SRAP引物进行多态性分析，筛选出了25对条带清晰、稳定性好的引物组合。
　　 2.通过对核桃的F1群体进行SRAP分析，得到了180个多态性位点，应用Joinmap3.0软件，构建了包含18个连锁群，有128个标记组成的核桃遗传连锁图谱。该图谱覆盖长度为1153.1cM，平均图距9.01cM。每个连锁群上的标记数在2-15之间，连锁群长度在8.2-90.7 cM之间。
　　 3.利用winqtlcart2.5软件，采用复合区间作图法，对核桃的数量性状进行QTL分析。检测到2个与树高相关的QTL位点sg-1、sg-2，均位于Lg11上，加性效应分别为-57.35、-47.42，可以解释的表型变异为7.31％、5％；检测到1个与萌芽力相关的QTL位点myl-1，位于Lg4上，加性效应为-3.55，可以解释的表型变异为3.58％；检测到3个与干果纵径相关的QTL位点zj-1、zj-2、zj-3，分别位于Lg4、Lg4、Lg8上，加性效应分别为0.32、-0.31、-0.91，可以解释的表型变异分别为10.59％、9.87％、6.93％；检测到1个与干果横径相关的QTL位点hj-1，位于Lg7上，加性效应分别为-0.12，可以解释的表型变异为4.53％；检测到2个与干果重相关

目录

文摘

英文文摘

符号说明

1 引言

1.1 DNA标记技术的类型

1.1.1 基于Southern杂交技术的分子标记

1.1.2 基于PCR技术的分子标记

1.1.3 以DNA序列为基础的分子标记

1.2 SRAP分子标记技术

1.2.1 SRAP分子标记技术的原理

1.2.2 SRAP分子标记技术的特点

1.2.3 SRAP标记的应用

1.3 DNA分子标记遗传连锁图谱构建

1.3.1 构建遗传连锁图谱的意义

1.3.2 构建遗传连锁图谱的理论基础

1.3.3 构建遗传连锁图谱的策略

1.4 QTL定位

1.4.1 QTL定位的原理及方法

1.4.2 SRAP标记进行QTL定位的研究

1.5 核桃分子标记的研究进展

1.6 核桃遗传连锁图谱的研究进展

1.7 本研究的目的和意义

2 材料和方法

2.1 实验材料

2.1.1 植物材料

2.1.2 实验试剂

2.1.3 实验仪器

2.1.4 SRAP引物

2.2 实验方法

2.2.1 核桃基因组DNA的提取

2.2.2 模板DNA浓度及质量检测

2.2.3 SRAP扩增

2.2.4 变性聚丙烯酰胺凝胶的制备与电泳

2.2.5 银染

2.2.6 标记命名与数据整理

2.2.7 遗传连锁图谱的构建

2.2.8 数量性状调查

2.2.9 QTL检测

3 结果与分析

3.1 核桃基因组DNA浓度与纯度的检测

3.2 SRAP多态性标记引物组合的筛选

3.3 SRAP标记在F1群体中的多态性与分离分析

3.3.1 hkxhk基因型分离类型

3.3.2 lmxll基因型分离类型

3.3.3 nnxnp基因型分离类型

3.4 作图群体的评价

3.5 遗传图谱的构建

3.6 数量性状的QTL定位结果

3.6.1 树高

3.6.2 萌芽力

3.6.3 干果纵径

3.6.4 干果横径

3.6.5 干果重

4 讨论

4.1 关于基因组DNA的提取

4.2 关于聚丙烯酰胺凝胶电泳及银染

4.3 关于作图群体

4.4 关于偏分离标记

4.5 关于连锁群与染色体数的对应关系

4.6 关于核桃的遗传图谱

4.7 关于QTL定位

5 结论

参考文献

附录

致谢

攻读学位期间发表的学术论文