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基于多组学研究氧化低密度脂蛋白致内皮细胞氧化损伤的分子机制

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第一章绪论

1.1内皮功能与心血管系统综述

1.1.1 NO功能与氧化应激

1.1.2内皮功能紊乱与动脉粥样硬化

1.1.3 ox-LDL的促动脉粥样硬化效应

1.2基于生物质谱的蛋白组分析

1.2.1生物质谱仪

1.2.2质谱的碎裂方式

1.2.3基于质谱的蛋白组定量研究方法

1.2.4蛋白组的质谱分析策略

1.3翻译后修饰

1.3.1翻译后修饰的种类

1.3.2翻译后修饰的功能

1.3.3翻译后修饰的分析策略

1.4亚硝基化修饰

1.4.1亚硝基化的特点

1.4.2亚硝基化与去亚硝基化

1.4.3亚硝基化蛋白的功能

1.4.4亚硝基化的分析方法

1.5内皮糖萼

1.5.1糖萼的结构

1.5.2糖萼的功能

1.5.3糖胺聚糖的常用研究方法

1.5.4糖胺聚糖与蛋白的相互作用

1.6论文大纲

第二章ox-LDL刺激下内皮细胞的定量蛋白组学研究

2.1引言

2.2实验材料

2.2.1试剂与耗材

2.2.2主要仪器

2.2.3色谱柱

2.2.4缓冲液及流动相的配制

2.3实验方法

2.3.1内皮细胞培养

2.3.2细胞凋亡试验

2.3.3数据统计

2.3.4蛋白酶解和iTRAQ标记

2.3.5一维高pH反相色谱离线分离

2.3.6 nanoLC-MS/MS分析

2.3.7数据处理

2.4.1细胞凋亡

2.4.2氧化应激下内皮细胞的蛋白组

2.4.3差异蛋白的功能富集分析

2.4.4蛋白相互作用网络分析

2.5本章小结

第三章ox-LDL刺激下内皮细胞的亚硝基化修饰酶研究

3.1引言

3.2试剂与耗材

3.2.1试剂与耗材

3.2.2主要仪器

3.2.3缓冲液及流动相的配制

3.3实验方法

3.3.1内皮细胞培养

3.3.2 NO定量检测

3.3.4 Western blot

3.4结果与讨论

3.4.1 NO含量与eNOS表达量检测

3.4.2总亚硝基化蛋白水平检测

3.4.3 GSNOR表达量检测

3.5本章小结

第四章ox-LDL刺激下内皮细胞亚硝基化蛋白组的定量研究

4.1引言

4.2药品与试剂

4.2.1试剂与耗材

4.2.2主要仪器

4.2.3色谱柱

4.2.4缓冲液及流动相的配制

4.3实验方法

4.3.1内皮细胞培养

4.3.2蛋白提取和浓度测定

4.3.3蛋白酶解

4.3.4亚硝基化肽段的富集

4.3.5 iTRAQ标记

4.3.7数据处理

4.4结果与讨论

4.4.1亚硝基化位点的鉴定

4.4.2亚硝基化蛋白的相对定量

4.4.3亚硝基化蛋白的功能富集

4.4.4亚硝基化蛋白的相互作用网络

4.4.5亚硝基化肽的分析

4.5本章小结

第五章ox-LDL刺激下内皮细胞硫酸乙酰肝素的表征

5.1引言

5.2药品与试剂

5.2.1试剂与耗材

5.2.2主要仪器

5.2.3色谱柱

5.2.4缓冲液及流动相的配制

5.3实验方法

5.3.1内皮细胞培养

5.3.2荧光检测

5.3.3硫酸乙酰肝素的提取和纯化

5.3.4 LC-MRM MS分析

5.3.5电泳分析

5.4结果与讨论

5.4.1硫酸乙酰肝素的荧光检测

5.4.2硫酸乙酰肝素的结构表征和含量测定

5.4.3硫酸乙酰肝素的分子量表征

5.5本章小结

第六章ox-LDL刺激下内皮细胞硫酸乙酰肝素结合蛋白的研究

6.1引言

6.2药品与试剂

6.2.1试剂与耗材

6.2.2主要仪器

6.2.3缓冲液及流动相的配制

6.3实验方法

6.3.1蛋白组芯片

6.3.2 BLI测定

6.3.3免疫共定位

6.3.4细胞凋亡

6.4结果与讨论

6.4.1硫酸乙酰肝素结合蛋白的筛选

6.4.2硫酸乙酰肝素结合蛋白的验证

6.4.3关键硫酸乙酰肝素结合蛋白的筛选

6.4.5硫酸乙酰肝素对胎球蛋白内吞的影响

6.4.4脱硫酸肝素与胎球蛋白的结合

6.4.6非抗凝肝素的保护作用

6.5本章小结

全文总结

参考文献

致谢

攻读博士学位期间发表的学术论文及申请的专利

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