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嗜酸性喜温硫杆菌中硫代硫酸盐代谢途径调控机制研究

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摘要

第一章研究背景

1.2嗜酸性喜温硫杆菌硫氧化系统的研究进展

1.3嗜酸性喜温硫杆菌中硫代硫酸盐的氧化

1.3.1 S4I途径

1.3.2 Sox系统

1.4双组分调控系统

1.4.1双组分调控系统的基本组成和作用机制

1.4.2双组分调控系统中HK的结构和活性

1.4.3双组分调控系统中RR的结构和活性

1.4.4嗜酸性喜温硫杆菌中双组分调控系统

1.5本论文研究意义和内容

1.5.1研究意义

1.5.2研究内容

第二章嗜酸性喜温硫杆菌中RsrR蛋白的生物信息学分析

2.1引言

2.2材料和方法

2.2.1软件与在线工具

2.3.1 RsrR氨基酸序列的理化性质分析

2.3.2 RsrR蛋白二级结构预测与分析

2.3.3 RsrR蛋白三级结构预测与分析

2.3.4 RsrR蛋白保守性氨基酸残基分析

2.3.5 RsrR蛋白与OmpR蛋白氨基酸序列比对

第三章RsrS-RsrR双组分系统调控方式研究

3.1引言

3.2材料与方法

3.2.1菌株与质粒

3.2.2培养基和培养条件

3.2.3试剂和仪器

3.2.4实验操作技术

3.3研究结果

3.3.1 egfp验证RsrS-RsrR双组分系统菌株构建

3.3.2 RNA质量及完整性的检测

3.3.3 cDNA的合成

3.3.4荧光定量PCR验证结果

3.4本章小结

4.1引言

4.2.1菌株和质粒

4.2.2培养基和培养条件

4.2.3试剂和仪器

4.2.4分子生物学相关操作技术

4.3实验结果与讨论

4.3.1 RsrR蛋白HTH结构域关键氨基酸位点的分析

4.3.2 RsrR及其氨基酸位点突变蛋白表达质粒的构建

4.3.3 RsrR及其氨基酸位点突变蛋白的异源表达

4.3.4 RsrR及其氨基酸位点突变蛋白的纯化

4.3.5目的片段的扩增

4.3.6RsrR及其氨基酸位点突变蛋白与T360片段的结合实验(EMSA)

4.3.7 RsrR及其氨基酸位点突变蛋白体内验证质粒的构建

4.3.8 RsrR及其氨基酸位点突变蛋白体内验证菌株的构建

4.3.9 RNA质量检测

4.3.10荧光定量PCR验证结果

4.3.11 RsrR关键氨基酸位点的生物信息学分析

4.4本章小结

5.1引言

5.2材料和方法

5.2.1菌株和质粒

5.2.2培养基和培养条件

5.2.3试剂和仪器

5.2.4分子生物学相关操作技术

5.3.2 IRS关键碱基位点突变——单点突变

5.3.3 IRS关键碱基位点突变——双点突变

5.4本章小结

第六章全文总结与展望

6.1本论文的主要创新点

6.2本论文的不足之处及展望

参考文献

致谢

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