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基于转录组测序的不同种源玫瑰(Rosa rugosa)群体遗传分化初步研究

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摘要

符号说明

第一章前言

1.1转录组测序的研究进展

1.1.1转录组测序技术的现状

1.1.2高通量测序技术在种群遗传研究中的应用

1.2玫瑰背景介绍

1.2.1玫瑰生物学特性

1.2.2中国野生玫瑰种群现状

1.2.3欧洲入侵种玫瑰种群现状及研究进展

1.2.4中国栽培玫瑰品种及研究进展

1.3玫瑰研究热点

1.3.1群体遗传分化与遗传多样性

1.3.2功能基因挖掘

1.4选题意义和研究目的

2.1采样群体

2.2样品采集方法、保存和处理

2.3表型观测

2.3.1玫瑰表型观测玫瑰生物学特性

2.3.2叶片氮含量测定

2.3.3叶片磷含量测定

2.4玫瑰群体转录组测序及组装

2.5数据处理

2.6技术路线

第三章玫瑰群体的表型差异与分化格局

3.1玫瑰群体表型性状多重比较

3.2玫瑰群体表型性状变异分析

3.3野生玫瑰群体表型性状与原产地生态因子相关性分析

3.4玫瑰群体表型性状聚类分析

3.5小结

第四章玫瑰群体的转录组分化格局

4.1测序产量、组装质量统计及功能注释

4.2玫瑰群体转录组的遗传分化研究

4.3玫瑰群体转录组差异表达基因DEG分析

4.3.1差异表达基因GO及Pathway显著性富集分析

4.3.2野生玫瑰种源差异表达基因显著性富集分析

4.4影响玫瑰群体遗传分化因素的初步分析

4.4.1玫瑰群体遗传分化差异初步研究

4.4.2耐寒相关候选基因筛选

4.5小结

第五章讨论

5.1玫瑰群体的表型差异

5.2玫瑰群体的分化格局

5.3影响玫瑰群体逮传分化的因素与可能途径

6.1结论

6.2创新点

6.3建议

附录

参考文献

致谢

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