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中国东北地区HIV/AIDS患者tat第一外显子基因变异特点及其二级结构变化与疾病进展关系的研究

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综述 HIV转录的重要调控因子:反式激活蛋白Tat

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摘要

目的:了解中国东北地区HIV/AIDS患者tat第一外显子的基因序列及其二级结构的特征和变异特点,探讨其与HIV-1感染者疾病进展之间的关系。 方法:收集我国东北地区HIV感染者的流行病学资料,临床资料及全血标本-80℃保存。HIV-1tat基因第一外显子基因序列测定:Qiaquick Spin kit从全血标本中提取基因组DNA(含有整合的HIV-1前病毒DNA),提取的DNA以tat调节基因区特异性引物NP7/ENV-1为外侧引物进行第一轮PCR扩增,以tat-B/NP11为内侧引物进行nested-PCR扩增。1﹪琼脂糖凝胶电泳检测目的扩增片断,与分子量Marker对比无误后切取该片断。QIAquick Gel Extraction Kit回收目的DNA片断。LI-COR Global IR2 System测序仪进行基因序列测定。 结论:1.我国AIDS人群中,B’和B’C重组亚型HIV-1tat基因第一外显子氨基酸序列变异与国外对B亚型毒株的研究结果一致,LTNP组中未见22,28,41,50位的基因突变;无症状感染组及AIDS组中均发现发生了58位T取代A,而LTNP组未见此取代变异,提示其与疾病进展相关。2.中国AIDS患者在tat基因第一外显子的一些取代变异与疾病进展有关。3.HIV感染后的疾病进展与tat蛋白二级结构无明显关系。

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